RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252487.9

TOMM40-201, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM40, Length 1,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-201ENST00000252487 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa23.9■■□□□ 1.42
TOMM40-201ENST00000252487 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
TOMM40-201ENST00000252487 SLC13A4Q9UKG4 626 aa23.9■■□□□ 1.42
TOMM40-201ENST00000252487 ABCG2Q9UNQ0 655 aa23.9■■□□□ 1.42
TOMM40-201ENST00000252487 NTNG1Q9Y2I2 539 aa23.9■■□□□ 1.42
TOMM40-201ENST00000252487 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa23.9■■□□□ 1.42
TOMM40-201ENST00000252487 G3V3Y1 287 aa23.9■■□□□ 1.42
TOMM40-201ENST00000252487 MGRN1O60291 552 aa23.9■■□□□ 1.42
TOMM40-201ENST00000252487 CYP7B1O75881 506 aa23.9■■□□□ 1.42
TOMM40-201ENST00000252487 CCL3P10147 92 aa23.9■■□□□ 1.42
TOMM40-201ENST00000252487 PRG2P13727 222 aa23.9■■□□□ 1.42
TOMM40-201ENST00000252487 SOX8P57073 446 aa23.9■■□□□ 1.42
TOMM40-201ENST00000252487 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
TOMM40-201ENST00000252487 NPTX1Q15818 432 aa23.9■■□□□ 1.42
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF227Q86WZ6 799 aa23.9■■□□□ 1.42
TOMM40-201ENST00000252487 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa23.9■■□□□ 1.42
TOMM40-201ENST00000252487 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa23.9■■□□□ 1.42
TOMM40-201ENST00000252487 OR6T1Q8NGN1 323 aa23.9■■□□□ 1.42
TOMM40-201ENST00000252487 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
TOMM40-201ENST00000252487 TMCO6Q96DC7 493 aa23.9■■□□□ 1.42
TOMM40-201ENST00000252487 ARHGDIGQ99819 225 aa23.9■■□□□ 1.42
TOMM40-201ENST00000252487 KLHDC3Q9BQ90 382 aa23.9■■□□□ 1.42
TOMM40-201ENST00000252487 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa23.9■■□□□ 1.42
TOMM40-201ENST00000252487 MAGIXQ9H6Y5 334 aa23.9■■□□□ 1.42
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
TOMM40-201ENST00000252487 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
TOMM40-201ENST00000252487 HRH3Q9Y5N1 445 aa23.9■■□□□ 1.42
TOMM40-201ENST00000252487 ADAM11O75078 769 aa23.89■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 WDPCPO95876 746 aa23.89■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 CSTAP01040 98 aa23.89■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 NGFRP08138 427 aa23.89■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 NRF1Q16656 503 aa23.89■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa23.89■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa23.89■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 TTC9Q92623 222 aa23.89■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 AGAP4Q96P64 663 aa23.89■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 METTL7AQ9H8H3 244 aa23.89■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 KLRF1Q9NZS2 232 aa23.89■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 HEATR5AQ86XA9 2040 aa23.89■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 ALG1L2C9J202 215 aa23.88■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 J3KTA2 159 aa23.88■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 SYT5O00445 386 aa23.88■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 CD96P40200 585 aa23.88■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 PTGDSP41222 190 aa23.88■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 HLCSP50747 726 aa23.88■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 BROXQ5VW32 411 aa23.88■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 DEF8Q6ZN54 512 aa23.88■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 CTPS2Q9NRF8 586 aa23.88■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 CARD8Q9Y2G2 431 aa23.88■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 NDUFB5O43674 189 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 TPST2O60704 377 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 SEMA7AO75326 666 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 BAG2O95816 211 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 ANGPTL1O95841 491 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 FABP3P05413 133 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 TUBA3CQ13748 450 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 IQCCQ4KMZ1 466 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 EIPR1Q53HC9 387 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 FBXW10Q5XX13 1052 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 OR5M10Q6IEU7 315 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 ZFP1Q6P2D0 407 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 TUBA3EQ6PEY2 450 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 CBLN3Q6UW01 205 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 ISLR2Q6UXK2 745 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 LILRA2Q8N149 483 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 LRTOMTQ8WZ04 291 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 PCNX3Q9H6A9 2034 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 IL1RAPQ9NPH3 570 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 ARMC1Q9NVT9 282 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 TP53I11O14683 189 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 UBL4AP11441 157 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 FUT4P22083 530 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 CASP3P42574 277 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 CYB561P49447 251 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 SPINK14Q6IE38 97 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 AAGABQ6PD74 315 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 RNF138Q8WVD3 245 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 PKP2Q99959 881 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 SH2D2AQ9NP31 389 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 KLHL28Q9NXS3 571 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 NDUFAF4Q9P032 175 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa23.87■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 B4DXG7 233 aa23.86■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 K7ENP7 123 aa23.86■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 IFNW1P05000 195 aa23.86■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 MAGEA2P43356 314 aa23.86■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 GAS1P54826 345 aa23.86■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF117Q03924 483 aa23.86■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
TOMM40-201ENST00000252487 RTL4Q6ZR62 310 aa23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms