RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 PRODH2Q9UF12 536 aa14.48□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 WNK2Q9Y3S1 2297 aa14.47□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 CXCL13O43927 109 aa14.47□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 SEMA3DO95025 777 aa14.47□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 GBAP04062 536 aa14.47□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 CT45A8P0DMV1 189 aa14.47□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 CT45A9P0DMV2 189 aa14.47□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 IL12BP29460 328 aa14.47□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 FABP6P51161 128 aa14.47□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 ARFIP2P53365 341 aa14.47□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 PNLIPRP2P54317 469 aa14.47□□□□□ -0.09
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SPCS1-201ENST00000233025 HILS1P60008 231 aa14.47□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 PHEXP78562 749 aa14.47□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 TRAF3Q13114 568 aa14.47□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 STK11Q15831 433 aa14.47□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 IQCCQ4KMZ1 466 aa14.47□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 HSP90B2PQ58FF3 399 aa14.47□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 CT45A2Q5DJT8 189 aa14.47□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF544Q6NX49 715 aa14.47□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 SHISA2Q6UWI4 295 aa14.47□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 NPSR1Q6W5P4 371 aa14.47□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 NUDT13Q86X67 352 aa14.47□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 BPESC1Q9GZL8 116 aa14.47□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 ACSS3Q9H6R3 686 aa14.47□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa14.46□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 LRP5LA4QPB2 252 aa14.46□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF814B7Z6K7 855 aa14.46□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM77I1YAP6 450 aa14.46□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 ADAMDEC1O15204 470 aa14.46□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 SYNGR4O95473 234 aa14.46□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 IL2RGP31785 369 aa14.46□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 DUSP2Q05923 314 aa14.46□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 STX5Q13190 355 aa14.46□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 ZSWIM7Q19AV6 140 aa14.46□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 RNF128Q8TEB7 428 aa14.46□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 ABHD3Q8WU67 409 aa14.46□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 SORCS2Q96PQ0 1159 aa14.46□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 PTGES2Q9H7Z7 377 aa14.46□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 POU2F3Q9UKI9 436 aa14.46□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 PCTPQ9UKL6 214 aa14.46□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 MGAT4BQ9UQ53 548 aa14.46□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 FKBP7Q9Y680 259 aa14.46□□□□□ -0.09
SPCS1-201ENST00000233025 FADS1O60427 444 aa14.45□□□□□ -0.1
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SPCS1-201ENST00000233025 TIMM23BQ5SRD1 257 aa14.45□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 LGSNQ5TDP6 509 aa14.45□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 FAM219BQ5XKK7 198 aa14.45□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 KLC3Q6P597 504 aa14.45□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 SLC22A25Q6T423 547 aa14.45□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 RELL1Q8IUW5 271 aa14.45□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa14.45□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 LINC01356Q8N9X3 169 aa14.45□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 SERPINI1Q99574 410 aa14.45□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 VPS11Q9H270 941 aa14.45□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 KLHL13Q9P2N7 655 aa14.45□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 CES1P1Q9UKY3 287 aa14.45□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa14.44□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 STX16O14662 325 aa14.44□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 TNFSF11O14788 317 aa14.44□□□□□ -0.1
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SPCS1-201ENST00000233025 DHRS4L1P0CG22 281 aa14.44□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 BMP4P12644 408 aa14.44□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF17P17021 662 aa14.44□□□□□ -0.1
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SPCS1-201ENST00000233025 CHRNB3Q05901 458 aa14.44□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 LTB4RQ15722 352 aa14.44□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 GGTA1PQ4G0N0 100 aa14.44□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM201Q5SNT2 666 aa14.44□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 FRG2Q64ET8 278 aa14.44□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM108Q6UXF1 575 aa14.44□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 Q6ZT83 130 aa14.44□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 USP43Q70EL4 1123 aa14.44□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 SSX8Q7RTT4 187 aa14.44□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 TUSC5Q8IXB3 177 aa14.44□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 OR2V1Q8NHB1 315 aa14.44□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 MUCL1Q96DR8 90 aa14.44□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 MTBPQ96DY7 904 aa14.44□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 PHF21BQ96EK2 531 aa14.44□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 VSTM2LQ96N03 204 aa14.44□□□□□ -0.1
SPCS1-201ENST00000233025 FRG2BQ96QU4 278 aa14.44□□□□□ -0.1
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