RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638481.1

SPIN3-208, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,050 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-208	ENST00000638481	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	CEP19	Q96LK0	163 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	NUAK2	Q9H093	628 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	RAB23	Q9ULC3	237 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	GPR75	O95800	540 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	FH	P07954	510 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	MSL3P1	P0C860	447 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	SOX18	P35713	384 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	GCGR	P47871	477 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	AVPR1B	P47901	424 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	ERV3-1	Q14264	604 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	GPR135	Q8IZ08	494 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	OR7G2	Q8NG99	324 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	DOK4	Q8TEW6	326 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	OR51I1	Q9H343	314 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SPIN3-208	ENST00000638481		M0R129	80 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF749	O43361	778 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	EMC8	O43402	210 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	ADA	P00813	363 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	POU2F1	P14859	743 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	ALAS2	P22557	587 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	CHM	P24386	653 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	PRR5	P85299	388 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	REEP3	Q6NUK4	255 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	NUP43	Q8NFH3	380 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	MOAP1	Q96BY2	351 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	RNF31	Q96EP0	1072 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	TPK1	Q9H3S4	243 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	EQTN	Q9NQ60	294 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	KCND3	Q9UK17	655 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	OR2W5	A6NFC9	320 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	C5orf58	C9J3I9	102 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481		H0YIG0	161 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	ATP1B1	P05026	303 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	BCHE	P06276	602 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF883	P0CG24	379 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	OR12D1	P0DN82	309 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	RCVRN	P35243	200 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	GRK6	P43250	576 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC15A1	P46059	708 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	OR1D4	P47884	311 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	RHAG	Q02094	409 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	ATCAY	Q86WG3	371 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	OR5M11	Q96RB7	305 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	CFAP54	Q96N23	3096 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	GAST	P01350	101 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	CRISP3	P54108	245 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SPIN3-208	ENST00000638481	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19

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