RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
JMJD1C-211	ENST00000633035	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	15.02	■□□□□ -0
JMJD1C-211	ENST00000633035	BMP5	P22003	454 aa		15.02	■□□□□ -0
JMJD1C-211	ENST00000633035	UQCRC2	P22695	453 aa		15.02	■□□□□ -0
JMJD1C-211	ENST00000633035	WNT3	P56703	355 aa		15.02	■□□□□ -0
JMJD1C-211	ENST00000633035	UFM1	P61960	85 aa		15.02	■□□□□ -0
JMJD1C-211	ENST00000633035	BCL2A1	Q16548	175 aa		15.02	■□□□□ -0
JMJD1C-211	ENST00000633035	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	15.02	■□□□□ -0
JMJD1C-211	ENST00000633035	APOOL	Q6UXV4	268 aa		15.02	■□□□□ -0
JMJD1C-211	ENST00000633035	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		15.02	■□□□□ -0
JMJD1C-211	ENST00000633035	MEIOB	Q8N635	442 aa		15.02	■□□□□ -0
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		15.02	■□□□□ -0
JMJD1C-211	ENST00000633035	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		15.02	■□□□□ -0
JMJD1C-211	ENST00000633035	TM9SF2	Q99805	663 aa		15.02	■□□□□ -0
JMJD1C-211	ENST00000633035	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		15.02	■□□□□ -0
JMJD1C-211	ENST00000633035	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		15.02	■□□□□ -0
JMJD1C-211	ENST00000633035	EXD2	Q9NVH0	621 aa		15.02	■□□□□ -0
JMJD1C-211	ENST00000633035	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		15.02	■□□□□ -0
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	15.02	■□□□□ -0
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035		H3BML4	177 aa		15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	ANKRD28	O15084	1053 aa		15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	DIAPH2	O60879	1101 aa		15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	AGR2	O95994	175 aa		15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	AK1	P00568	194 aa		15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	IDO1	P14902	403 aa		15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	LHX2	P50458	406 aa		15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZAR1	Q86SH2	424 aa		15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF614	Q8N883	585 aa		15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR52E6	Q96RD3	313 aa		15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	PANX1	Q96RD7	426 aa		15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	VDAC3	Q9Y277	283 aa		15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A087WZY1	265 aa		15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A1W2PQD3	144 aa		15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR2M5	A3KFT3	312 aa		15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	CLCA1	A8K7I4	914 aa		15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	HCRTR2	O43614	444 aa		15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	NUDT14	O95848	222 aa		15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF708	P17019	499 aa		15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	CTSS	P25774	331 aa		15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	OPRM1	P35372	400 aa		15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	ATP12A	P54707	1039 aa		15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	GSTA3	Q16772	222 aa		15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	SMPDL3B	Q92485	455 aa		15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	WNT2B	Q93097	391 aa		15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		15	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035		B4DXG7	233 aa		14.99	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	UBD	O15205	165 aa		14.99	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	SEC14L5	O43304	696 aa		14.99	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	SCN2B	O60939	215 aa		14.99	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	STX11	O75558	287 aa		14.99	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC22A3	O75751	556 aa		14.99	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	PGR	P06401	933 aa		14.99	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRF1	P14222	555 aa		14.99	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	SSTR2	P30874	369 aa		14.99	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	CLDN18	P56856	261 aa		14.99	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		14.99	□□□□□ -0.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms