RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449		A0A0B4J203	849 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449		A0A0G2JPF8	293 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	SDC3	O75056	442 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	CLEC3A	O75596	197 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	TATDN3	Q17R31	274 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	HES5	Q5TA89	166 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	TMIE	Q8NEW7	156 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	RASD1	Q9Y272	281 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	TSC2	P49815	1807 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	PTPRD	P23468	1912 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	SOBP	A7XYQ1	873 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	SEMA3D	O95025	777 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	ADH7	P40394	386 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC1A3	P43003	542 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	ABAT	P80404	500 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	ADAM15	Q13444	863 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	FXN	Q16595	210 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	SAXO2	Q658L1	398 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	TM9SF4	Q92544	642 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	RAB7B	Q96AH8	199 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	CDC14C	A4D256	554 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	GABRP	O00591	440 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	NPC1	O15118	1278 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	DOK2	O60496	412 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	CLU	P10909	449 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	PRPH2	P23942	346 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	P2RY14	Q15391	338 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM64	Q6YI46	380 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	ABHD13	Q7L211	337 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM163	Q8TC26	289 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	NUDT15	Q9NV35	164 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	ING4	Q9UNL4	249 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	MOSPD3	O75425	235 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	RCBTB2	O95199	551 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	MAGEA8	P43361	318 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	BNC1	Q01954	994 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	PRKCD	Q05655	676 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	SQSTM1	Q13501	440 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	ENPP2	Q13822	863 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	EIPR1	Q53HC9	387 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	CCDC80	Q76M96	950 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	CDH24	Q86UP0	819 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	GJD3	Q8N144	294 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	THEM6	Q8WUY1	208 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	C4orf36	Q96KX1	117 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	RNF121	Q9H920	327 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449		A0A1W2PQ72	361 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	LYRM1	O43325	122 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	MT-ND5	P03915	603 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	REEP5	Q00765	189 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	RPA4	Q13156	261 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	DUSP5	Q16690	384 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	NATD1	Q8N6N6	113 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	ELP4	Q96EB1	424 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC38A3	Q99624	504 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
ACSS3-208	ENST00000616449	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5

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