RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589469.5

PSME3-209, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 3

Gene PSME3, Length 733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-209	ENST00000589469	PGR	P06401	933 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	CPN1	P15169	458 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	MATN1	P21941	496 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	ADH7	P40394	386 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	RCAN2	Q14206	197 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	RAET1L	Q5VY80	246 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	EPGN	Q6UW88	154 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	MISP	Q8IVT2	679 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	GATS	Q8NAP1	163 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	OR52E6	Q96RD3	313 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469		Q9UFV3	132 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469		A0A1W2PQD3	144 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469		H0Y3Z8	333 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	AK1	P00568	194 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	LHX2	P50458	406 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF527	Q8NB42	609 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	PANX1	Q96RD7	426 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	TRIB1	Q96RU8	372 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		18.18	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	CD8B2	A6NJW9	211 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	HSPB2	A8KAH6	182 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	GMFG	O60234	142 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	IL6	P05231	212 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	COX6B1	P14854	86 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	MSX1	P28360	303 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	STAR	P49675	285 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	SRY	Q05066	204 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	HSPB2	Q16082	182 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	SAXO2	Q658L1	398 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	MARVELD3	Q96A59	401 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	NEURL3	Q96EH8	262 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	MAGEB18	Q96M61	343 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	OR51I1	Q9H343	314 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	CALHM2	Q9HA72	323 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	EXD2	Q9NVH0	621 aa		18.17	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469		H3BNH8	94 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	C19orf84	I3L1E1	186 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	LINC01387	J3KSC0	135 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	AGR2	O95994	175 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	TIMP3	P35625	211 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	KHK	P50053	298 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	ATP12A	P54707	1039 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	CASP9	P55211	416 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	BCL2A1	Q16548	175 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	MIER2	Q8N344	545 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	SDF2	Q99470	211 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	UCK2	Q9BZX2	261 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	RUBCNL	Q9H714	662 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	DNAJC13	O75165	2243 aa		18.16	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469		A0A087WZY1	265 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	CCDC154	A6NI56	674 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	TOX	O94900	526 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	IL2RA	P01589	272 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	NPIPA8	P0DM63	369 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	PEPD	P12955	493 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF708	P17019	499 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	IDH3A	P50213	366 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	CLDN18	P56856	261 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	STX1B	P61266	288 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	CD226	Q15762	336 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	KLHL26	Q53HC5	615 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	ARSK	Q6UWY0	536 aa		18.15	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5

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