RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 LOC100996750A0A140TA64 210 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 H0YC42 278 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 SCDO00767 359 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 BIRC5O15392 142 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 ZIC3O60481 467 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 ERLIN1O75477 346 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 KCNK2O95069 426 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 NKX2-2O95096 273 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 NUDT14O95848 222 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 CPN1P15169 458 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF708P17019 499 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 PRPS1L1P21108 318 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 OPRM1P35372 400 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 FRKP42685 505 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 CCT3P49368 545 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 CLDN18P56856 261 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 SIRPAP78324 504 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 RELBQ01201 579 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 FOXF2Q12947 444 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 STX3Q13277 289 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 GANABQ14697 944 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 FADS6Q8N9I5 356 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 OR56A1Q8NGH5 318 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 ZPLD1Q8TCW7 415 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 GIMAP5Q96F15 307 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 TM9SF2Q99805 663 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 DUSP26Q9BV47 211 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 PINK1Q9BXM7 581 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 NUF2Q9BZD4 464 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM185BQ9H7F4 350 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 CXorf36Q9H7Y0 433 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 CALHM2Q9HA72 323 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 FBXO34Q9NWN3 711 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 CRIM1Q9NZV1 1036 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 KCNN3Q9UGI6 736 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 RAP2CQ9Y3L5 183 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 L3MBTL1Q9Y468 752 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-209ENST00000587957 ABCA12Q86UK0 2595 aa9.65□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM120BA0PK00 339 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 OR2M5A3KFT3 312 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC22A20A6NK97 555 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 LILRA1O75019 489 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 IFI6P09912 130 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 KITP10721 976 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 PEPDP12955 493 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 CHMP24386 653 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 RPL14P50914 215 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 NME5P56597 212 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 RPS26P62854 115 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 C17orf67Q0P5P2 114 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 SGCBQ16585 318 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 OR4F3Q6IEY1 312 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 CDC73Q6P1J9 531 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 APOOLQ6UXV4 268 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 CROCCP2Q86T23 111 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 ANKRD46Q86W74 232 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 CLECL1Q8IZS7 167 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 CLEC4FQ8N1N0 589 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 ACBD4Q8NC06 268 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 OR5D16Q8NGK9 328 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 OR4A15Q8NGL6 344 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 OR6Y1Q8NGX8 325 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 OR4C3Q8NH37 302 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 RFWD2Q8NHY2 731 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 RNF217Q8TC41 542 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 ADAMTS15Q8TE58 950 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 RNF138Q8WVD3 245 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 OR5P2Q8WZ92 322 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 NRGNQ92686 78 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 SH3GL2Q99962 352 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 PIGQQ9BRB3 760 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 G6PC3Q9BUM1 346 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 BTBD2Q9BX70 525 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 ACTRT3Q9BYD9 372 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 DPY30Q9C005 99 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 C20orf27Q9GZN8 174 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 AKTIPQ9H8T0 292 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-209ENST00000587957 NEUROD4Q9HD90 331 aa9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms