RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	TAGAP	Q8N103	731 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	BBS10	Q8TAM1	723 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SFXN5	Q8TD22	340 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ARRDC3	Q96B67	414 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	YIPF6	Q96EC8	236 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	DACH2	Q96NX9	599 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SARG	Q9BW04	601 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	MS4A8	Q9BY19	250 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	OR51B5	Q9H339	312 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ACER3	Q9NUN7	267 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	MKLN1	Q9UL63	735 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	RAB23	Q9ULC3	237 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A1W2PRQ8	180 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	OR2A25	A4D2G3	310 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM202	A6NGA9	273 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	PRRT4	C9JH25	899 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289		H0YIZ8	118 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SYT5	O00445	386 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	PPM1D	O15297	605 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	B4GAT1	O43505	415 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ASNA1	O43681	348 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	OR1F1	O43749	312 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	AIRE	O43918	545 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SULT1C4	O75897	302 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	INMT	O95050	263 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	KAT7	O95251	611 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ETHE1	O95571	254 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SOD1	P00441	154 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	IL3	P08700	152 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	IFI6	P09912	130 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	TFPT	P0C1Z6	253 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	NR2F1	P10589	423 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ACADM	P11310	421 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	HLA-E	P13747	358 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ETFA	P13804	333 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	EPCAM	P16422	314 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CD36	P16671	472 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	IL7R	P16871	459 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CEBPB	P17676	345 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ITGB8	P26012	769 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	PSMB9	P28065	219 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	HTR1B	P28222	390 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CMPK1	P30085	196 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	NTS	P30990	170 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	BSG	P35613	385 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	STT3A	P46977	705 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CAPZA2	P47755	286 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNJ5	P48544	419 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	KHK	P50053	298 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CLCNKA	P51800	687 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	PPP5C	P53041	499 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	MVD	P53602	400 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CRISP1	P54107	249 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CRISP3	P54108	245 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CDH12	P55289	794 aa		4.23	□□□□□ -1.73

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