RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, human

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRIM25-208	ENST00000574234	MYBL1	P10243	752 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CPN1	P15169	458 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PTPN6	P29350	595 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ATP6V1E1	P36543	226 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	GP5	P40197	560 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ARHGAP25	P42331	645 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SLCO1A2	P46721	670 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TRPC1	P48995	793 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC37A1	P57057	533 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	HILS1	P60008	231 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SKP1	P63208	163 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SEMA3A	Q14563	771 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PDK2	Q15119	407 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	VRK3	Q8IV63	474 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PQLC3	Q8N755	202 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	OR8K3	Q8NH51	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TMCO6	Q96DC7	493 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	STARD4	Q96DR4	205 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	OLFM3	Q96PB7	478 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	FCRL5	Q96RD9	977 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PKP2	Q99959	881 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	UBQLN3	Q9H347	655 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	KIAA1456	Q9P272	454 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	FETUB	Q9UGM5	382 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	VWC2L	B2RUY7	222 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	WWP2	O00308	870 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	MYO1D	O94832	1006 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CD8A	P01732	235 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CYP1A2	P05177	515 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	MAOA	P21397	527 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CPT2	P23786	658 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	GDF1	P27539	372 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PIGA	P37287	484 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	HNF4A	P41235	474 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CCR8	P51685	355 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	MFAP4	P55083	255 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	BTG2	P78543	158 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ABAT	P80404	500 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	HERC3	Q15034	1050 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PGGHG	Q32M88	737 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ODF2	Q5BJF6	829 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	DCST1	Q5T197	706 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	OR2A2	Q6IF42	318 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	HSDL2	Q6YN16	418 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms