RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571507.5

P4HB-215, Transcript of prolyl 4-hydroxylase subunit beta, human

TSL 2

Gene P4HB, Length 493 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
P4HB-215	ENST00000571507	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	ALG1L2	C9J202	215 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	C16orf97	H3BN30	126 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	SCD	O00767	359 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	TBX19	O60806	448 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	TRIM13	O60858	407 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	AQP8	O94778	261 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	KCNK2	O95069	426 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	NKX2-2	O95096	273 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	HSPA4L	O95757	839 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	CGA	P01215	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	IGKV1D-16	P01601	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	ALOX5	P09917	674 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	LINC00032	P0C843	101 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	ACP2	P11117	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	TBXA2R	P21731	343 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	CRYGS	P22914	178 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	ME2	P23368	584 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	HOXC12	P31275	282 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	MAP3K8	P41279	467 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	ASMT	P46597	345 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	SERPINB4	P48594	390 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	PRIM2	P49643	509 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	GUSBP1	Q15486	140 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	DUSP5	Q16690	384 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	GALNTL6	Q49A17	601 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	ZNF385B	Q569K4	471 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507		Q5PR19	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	SHE	Q5VZ18	495 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	APOOL	Q6UXV4	268 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507		Q6ZSR9	355 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	ZNF550	Q7Z398	422 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	BIVM	Q86UB2	503 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	MISP	Q8IVT2	679 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	COX18	Q8N8Q8	333 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	GATS	Q8NAP1	163 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	NUP43	Q8NFH3	380 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	OR4C3	Q8NH37	302 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	OR10D3	Q8NH80	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	AGR3	Q8TD06	166 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	CAVIN3	Q969G5	261 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	PIGT	Q969N2	578 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	MTERF3	Q96E29	417 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	GIMAP5	Q96F15	307 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	APOPT1	Q96IL0	206 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	C18orf12	Q96KH6	178 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	RNF145	Q96MT1	663 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	CCL19	Q99731	98 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	MKS1	Q9NXB0	559 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	NTM	Q9P121	344 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	DNAJC13	O75165	2243 aa		4.93	□□□□□ -1.62
P4HB-215	ENST00000571507	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62

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