RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568514.5

SNAP23-218, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 3

Gene SNAP23, Length 1,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-218	ENST00000568514	LHCGR	P22888	699 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	ACP1	P24666	158 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	TEAD1	P28347	426 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	3.1	□□□□□ -1.91	3e-6	■■■■□ 21.3
SNAP23-218	ENST00000568514	UGT1A3	P35503	534 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	UGT1A5	P35504	534 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	HMGCL	P35914	325 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	ATP6V1E1	P36543	226 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	CASP3	P42574	277 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	NSG1	P42857	185 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	KCNJ1	P48048	391 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	FNTA	P49354	379 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	ACADVL	P49748	655 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	CLCNKA	P51800	687 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	UCN	P55089	124 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	OR1D5	P58170	312 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	DCDC1	P59894	354 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	CCL7	P80098	99 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	CCZ1B	P86790	482 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	CDK16	Q00536	496 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	MZT1	Q08AG7	82 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	HSPB3	Q12988	150 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	MELK	Q14680	651 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	NR1D2	Q14995	579 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	C8orf74	Q6P047	294 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	CENPU	Q71F23	418 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	ZNF534	Q76KX8	674 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	CCDC190	Q86UF4	302 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	TIGD4	Q8IY51	512 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	SLC25A45	Q8N413	288 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	OR4L1	Q8NH43	312 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	LCN9	Q8WX39	176 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	ATL1	Q8WXF7	558 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	TAAR8	Q969N4	342 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	SGF29	Q96ES7	293 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	MS4A14	Q96JA4	679 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	OLFM3	Q96PB7	478 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	TGM7	Q96PF1	710 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	LYSMD1	Q96S90	227 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	NAT9	Q9BTE0	207 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	WWP1	Q9H0M0	922 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	FGF22	Q9HCT0	170 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	KLK13	Q9UKR3	277 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	SNX12	Q9UMY4	172 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	GAB2	Q9UQC2	676 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	ASF1A	Q9Y294	204 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	PTPRD	P23468	1912 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514	VCAN	P13611	3396 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SNAP23-218	ENST00000568514		A0A0U1RQS6	177 aa		3.09	□□□□□ -1.91

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