RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568290.1

ATXN3-250, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-250ENST00000568290 ACP5P13686 325 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 PRG2P13727 222 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 STOMP27105 288 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 NOS3P29474 1203 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 TGFBR1P36897 503 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 OMPP47874 163 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 GPR143P51810 404 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 ERVFC1P60507 584 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 ERVK-21P61565 698 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 TNFRSF17Q02223 184 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 MXD1Q05195 221 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 FPGSQ05932 587 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 HYAL2Q12891 473 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 TNK1Q13470 666 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 RUNX3Q13761 415 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 ZNF79Q15937 498 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 CYP27C1Q4G0S4 372 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 CCDC58Q4VC31 144 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 SLC35D3Q5M8T2 416 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 CCNJQ5T5M9 372 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 MFSD12Q6NUT3 480 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 CNIH2Q6PI25 160 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 SMARCD3Q6STE5 483 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 TMEM107Q6UX40 140 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 GATAD2AQ86YP4 633 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 SYS1Q8N2H4 156 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 LNX2Q8N448 690 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 OR52E1Q8NGJ3 308 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 FANK1Q8TC84 345 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 ZFAND1Q8TCF1 268 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 ASB16Q96NS5 453 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 OR2M4Q96R27 311 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 OR2M2Q96R28 347 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 MNTQ99583 582 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 TMEM246Q9BRR3 403 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 BARHL1Q9BZE3 327 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 ABCG4Q9H172 646 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 MED28Q9H204 178 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 SLC38A1Q9H2H9 487 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 SRMSQ9H3Y6 488 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 TBC1D17Q9HA65 648 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 SLAMF7Q9NQ25 335 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 CMC2Q9NRP2 79 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 DUX4Q9UBX2 424 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 POU2F3Q9UKI9 436 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 PLAGL1Q9UM63 463 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 SH2B3Q9UQQ2 575 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 A0A1W2PR48 441 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 OR6C70A6NIJ9 312 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 HSPB2A8KAH6 182 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 PRRT4C9JH25 899 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 K7ESM1 405 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 TFECO14948 347 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 PLPP2O43688 288 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 SULT1B1O43704 296 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 PLOD3O60568 738 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 ZNF432O94892 652 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 UBL3O95164 117 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 KAT7O95251 611 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 APBB3O95704 486 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 IGF2P01344 180 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 TP53P04637 393 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 TACSTD2P09758 323 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 LIMS3P0CW19 117 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 LIMS4P0CW20 117 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 NID1P14543 1247 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 NPR2P20594 1047 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 FAUP35544 74 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 NUDT1P36639 197 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 OPRD1P41143 372 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 BCL6P41182 706 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 AVPR1BP47901 424 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 CENPAP49450 140 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 CTBP2P56545 445 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 NRG3P56975 720 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 SCAND1P57086 179 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 RAB14P61106 215 aa7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 RPS7P62081 194 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 RPS25P62851 125 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ATXN3-250ENST00000568290 BTN3A2P78410 334 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms