RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561817.5

CAPN3-210, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPN3, Length 915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-210ENST00000561817 MMACHCQ9Y4U1 282 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 CACNA1HO95180 2353 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 CPED1A4D0V7 1026 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 FAM221AA4D161 298 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 TMEM247A6NEH6 219 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 AGAP5A6NIR3 686 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 A8MU76 341 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 LYPD3O95274 346 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 BMP10O95393 424 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 TIAF1O95411 115 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 CPNE6O95741 557 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 CER1O95813 267 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 IGKV1D-16P01601 117 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 THY1P04216 161 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 IGKV3-11P04433 115 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 ALPPP05187 535 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 ALOX5P09917 674 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 ZNF883P0CG24 379 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 CT45A8P0DMV1 189 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 CT45A9P0DMV2 189 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 SSTR4P31391 388 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 RYKP34925 604 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 OR1D4P47884 311 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 ALDH3B2P48448 385 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 ZNF136P52737 540 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 RAD23AP54725 363 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 CD47Q08722 323 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 SLC13A2Q13183 592 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 BIKQ13323 160 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 IL18R1Q13478 541 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 RAPSNQ13702 412 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 DGCR6Q14129 220 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 KEAP1Q14145 624 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 GANABQ14697 944 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
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CAPN3-210ENST00000561817 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 GPAT3Q53EU6 434 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 COLEC12Q5KU26 742 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 DCST2Q5T1A1 773 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 CCNJQ5T5M9 372 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 ATAD3BQ5T9A4 648 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 MLIPQ5VWP3 458 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 QSOX2Q6ZRP7 698 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 GALNT12Q8IXK2 581 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 PARP8Q8N3A8 854 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 SLC38A9Q8NBW4 561 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 MORN4Q8NDC4 146 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 OR10G2Q8NGC3 310 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 OR9Q2Q8NGE9 314 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 OR52P1PQ8NH57 321 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 PIK3R3Q92569 461 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 SLC9A6Q92581 669 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 PROX1Q92786 737 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 DIO2Q92813 273 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 RIT1Q92963 219 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 NAT6Q93015 286 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 LOXL4Q96JB6 756 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 GSX2Q9BZM3 304 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 POLE3Q9NRF9 147 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 FGF21Q9NSA1 209 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
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CAPN3-210ENST00000561817 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 MKLN1Q9UL63 735 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 CLCA2Q9UQC9 943 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 MAU2Q9Y6X3 613 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 FRYLO94915 3013 aa6.04□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 A0A1B0GX78 115 aa6.04□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.04□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 LNP1A1A4G5 178 aa6.04□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 SH3PXD2BA1X283 911 aa6.04□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 CLDN24A6NM45 220 aa6.04□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 PROB1E7EW31 1015 aa6.04□□□□□ -1.44
CAPN3-210ENST00000561817 FAAHO00519 579 aa6.04□□□□□ -1.44
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