RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557667.5

RBM23-233, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 1 (best)

Gene RBM23, Length 4,240 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-233	ENST00000557667	WNT4	P56705	351 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	ST3GAL4	Q11206	333 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	FAM189A2	Q15884	450 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	DEFB134	Q4QY38	66 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	SLC34A3	Q8N130	599 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	FANK1	Q8TC84	345 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	TMEM239	Q8WW34	195 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	SGTB	Q96EQ0	304 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	CUTC	Q9NTM9	273 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	CBLC	Q9ULV8	474 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	USP22	Q9UPT9	525 aa		7.91	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	GNAO1	P09471	354 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	SLC5A2	P31639	672 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	SCAND1	P57086	179 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	CLDN2	P57739	230 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	XAF1	Q6GPH4	301 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	TRIL	Q7L0X0	811 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	SLC35A4	Q96G79	324 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	C12orf49	Q9H741	205 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667		A0A1B0GX78	115 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	YY2	O15391	372 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	GPRIN2	O60269	458 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	PIAS2	O75928	621 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	NDUFB2	O95178	105 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	CD1E	P15812	388 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	MAP3K8	P41279	467 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	PNLIPRP2	P54317	469 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	FOXK2	Q01167	660 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	RUNX2	Q13950	521 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	CCDC58	Q4VC31	144 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	MCFD2	Q8NI22	146 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	MYLIP	Q8WY64	445 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	MAL2	Q969L2	176 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	KCTD7	Q96MP8	289 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	KLHL31	Q9H511	634 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		7.9	□□□□□ -1.14
RBM23-233	ENST00000557667		A6NIZ1	184 aa		7.9	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	ENTPD6	O75354	484 aa		7.9	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	MT-ND5	P03915	603 aa		7.9	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	CHRM4	P08173	479 aa		7.9	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	ATP6V1E1	P36543	226 aa		7.9	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	RAP1B	P61224	184 aa		7.9	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	RAP1A	P62834	184 aa		7.9	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	PPP3R1	P63098	170 aa		7.9	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	SPHAR	Q15513	63 aa		7.9	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	7.9	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	KLHL26	Q53HC5	615 aa		7.9	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		7.9	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	SYS1	Q8N2H4	156 aa		7.9	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		7.9	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	SVIP	Q8NHG7	77 aa		7.9	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		7.9	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		7.9	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	CDHR4	A6H8M9	788 aa		7.89	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	7.89	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	7.89	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	GAST	P01350	101 aa		7.89	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	7.89	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	7.89	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	CPE	P16870	476 aa		7.89	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	7.89	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	IL12B	P29460	328 aa		7.89	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	FMO3	P31513	532 aa		7.89	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	GABRA5	P31644	462 aa		7.89	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	PPP5C	P53041	499 aa		7.89	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	SYPL1	Q16563	259 aa		7.89	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	7.89	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		7.89	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	STK35	Q8TDR2	534 aa		7.89	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	NACC2	Q96BF6	587 aa		7.89	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	LGALS12	Q96DT0	336 aa		7.89	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		7.89	□□□□□ -1.15
RBM23-233	ENST00000557667	SLITRK2	Q9H156	845 aa		7.89	□□□□□ -1.15

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