RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553287.5

ATXN3-217, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 726 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-217ENST00000553287 DEFB133Q30KQ1 61 aa3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 TPRG1LQ5T0D9 272 aa3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 C9orf64Q5T6V5 341 aa3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 SPOPLQ6IQ16 392 aa3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 ZNF720Q7Z2F6 126 aa3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 C5orf24Q7Z6I8 188 aa3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 NRARPQ7Z6K4 114 aa3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 PRUNE1Q86TP1 453 aa3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 FAM219AQ8IW50 185 aa3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 CCDC83Q8IWF9 413 aa3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 PRSS35Q8N3Z0 413 aa3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 OR2T34Q8NGX1 318 aa3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 OR4C6Q8NH72 309 aa3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 SPPL2AQ8TCT8 520 aa3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 CCDC127Q96BQ5 260 aa3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 C8orf76Q96K31 380 aa3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 TSPAN18Q96SJ8 248 aa3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 TIPINQ9BVW5 301 aa3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 IL37Q9NZH6 218 aa3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 KLK11Q9UBX7 282 aa3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 PISDQ9UG56 409 aa3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 GGA2Q9UJY4 613 aa3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa3.65□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 SCN8AQ9UQD0 1980 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 RP1P56715 2156 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 FAM92AA1XBS5 289 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 NKX6-3A6NJ46 265 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 H0YCG3 227 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 UBE2CO00762 179 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 PRAF2O60831 178 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 TBL1XO60907 577 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 TBCAO75347 108 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 TNNC2P02585 160 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 TNNI1P19237 187 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 C4BPBP20851 252 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 DRD3P35462 400 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 CSKP41240 450 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 NDST1P52848 882 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 RIPPLY3P57055 190 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 TNNC1P63316 161 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 FAM166AQ6J272 317 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 DHRS11Q6UWP2 260 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 CLEC20AQ6ZU45 233 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 SYCP3Q8IZU3 236 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 APCDD1Q8J025 514 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 GPD1LQ8N335 351 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 ARL14Q8N4G2 192 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 CARNMT1Q8N4J0 409 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 SLC26A7Q8TE54 656 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 SSC4DQ8WTU2 575 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 RAD54LQ92698 747 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 SMARCD1Q96GM5 515 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 IL1RAPQ9NPH3 570 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 C5AR2Q9P296 337 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 CYTH4Q9UIA0 394 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 TSPAN16Q9UKR8 245 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 ODF2LQ9ULJ1 636 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 SCML2Q9UQR0 700 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 KIF3AQ9Y496 699 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 C2CD3Q4AC94 2353 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 HIVEP1P15822 2718 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 DCHS2Q6V1P9 2916 aa3.64□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 ARHGEF33A8MVX0 844 aa3.63□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 C10orf142B7Z368 130 aa3.63□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 RAD51BO15315 384 aa3.63□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 DUX1O43812 170 aa3.63□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.63□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 GOT1P17174 413 aa3.63□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 GIFP27352 417 aa3.63□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 CLDN17P56750 224 aa3.63□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 BTG1P62324 171 aa3.63□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 RPS24P62847 133 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 CCL7P80098 99 aa3.63□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 CNTN1Q12860 1018 aa3.63□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 CAMK2DQ13557 499 aa3.63□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 MPPE1Q53F39 396 aa3.63□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 C16orf54Q6UWD8 224 aa3.63□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 GCNT7Q6ZNI0 430 aa3.63□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 Q6ZSR6 202 aa3.63□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 NELFCDQ8IXH7 590 aa3.63□□□□□ -1.83
ATXN3-217ENST00000553287 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms