RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-229ENST00000551936 NPAS1Q99742 590 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 RNF122Q9H9V4 155 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 NDRG3Q9UGV2 375 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 VDAC3Q9Y277 283 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-229ENST00000551936 ZNF175Q9Y473 711 aa13.03□□□□□ -0.32
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CS-229ENST00000551936 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
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CS-229ENST00000551936 PEX11AO75192 247 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP13.02□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 SLU7O95391 586 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 ALOX5P09917 674 aa13.02□□□□□ -0.33
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CS-229ENST00000551936 CPOXP36551 454 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 PON3Q15166 354 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 POU4F3Q15319 338 aa13.02□□□□□ -0.33
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CS-229ENST00000551936 SZRD1Q7Z422 152 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 GGNQ86UU5 652 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 OR7A2PQ8NGA2 310 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 FNDC9Q8TBE3 224 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 SMPDL3BQ92485 455 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 PPP3R2Q96LZ3 170 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 TESMINQ9Y4I5 508 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 A0A087WZY1 265 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 A0A1W2PRB8 838 aa13.01□□□□□ -0.33
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CS-229ENST00000551936 CASKO14936 926 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 CD8BP10966 210 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 LAMP1P11279 417 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 ZNF17P17021 662 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 KLK2P20151 261 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 MAPK1P28482 360 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 SERPINB5P36952 375 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 CD79BP40259 229 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 PRIM2P49643 509 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 SIRPAP78324 504 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 IFFO1Q0D2I5 559 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 DEFB113Q30KQ7 82 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 C6orf136Q5SQH8 315 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 ZNF610Q8N9Z0 462 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 GATSQ8NAP1 163 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 AGR3Q8TD06 166 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 NUDT8Q8WV74 236 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 ADGRG7Q96K78 797 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 KLHDC3Q9BQ90 382 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 PIGUQ9H490 435 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 HHATLQ9HCP6 504 aa13.01□□□□□ -0.33
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CS-229ENST00000551936 GIN1Q9NXP7 522 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 ELOVL5Q9NYP7 299 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 A0A1W2PQD3 144 aa13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 TYROBPO43914 113 aa13□□□□□ -0.33
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CS-229ENST00000551936 BPGMP07738 259 aa13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 POU2F1P14859 743 aa13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 DDX5P17844 614 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 HPCAL1P37235 193 aa13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 RPL3P39023 403 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 ETV4P43268 484 aa13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 SERPINB4P48594 390 aa13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 ADAM8P78325 824 aa13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 KEAP1Q14145 624 aa13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 PTGR1Q14914 329 aa13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 SGCBQ16585 318 aa13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 CCNJQ5T5M9 372 aa13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 CPTPQ5TA50 214 aa13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 IL23RQ5VWK5 629 aa13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 MISPQ8IVT2 679 aa13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 COX18Q8N8Q8 333 aa13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 PSMA8Q8TAA3 256 aa13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 POC1BQ8TC44 478 aa13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 ACTRT2Q8TDY3 377 aa13□□□□□ -0.33
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CS-229ENST00000551936 CDS1Q92903 461 aa13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 COQ8BQ96D53 544 aa13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 STACQ99469 402 aa13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 C1orf50Q9BV19 199 aa13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 BTBD2Q9BX70 525 aa13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 DUSP22Q9NRW4 184 aa13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 MED17Q9NVC6 651 aa13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 STOML1Q9UBI4 398 aa13□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 ABCA4P78363 2273 aa12.99□□□□□ -0.33
CS-229ENST00000551936 C7orf72A4D263 438 aa12.99□□□□□ -0.33
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