RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541576.5

THBS3-210, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,200 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-210ENST00000541576 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 PRRG3Q9BZD7 231 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 REEP1Q9H902 201 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 FAM86C1Q9NVL1 165 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 SLC39A1Q9NY26 324 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 COQ3Q9NZJ6 369 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 PRODH2Q9UF12 536 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 MKLN1Q9UL63 735 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 SEMA7AO75326 666 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 EPPINO95925 133 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 ZNF28P17035 718 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 FOXL2P58012 376 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 PSG6Q00889 435 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 DAG1Q14118 895 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 ZNF311Q5JNZ3 666 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 ZNF615Q8N8J6 731 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 ZNF347Q96SE7 839 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 OR8D2Q9GZM6 311 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 ZNF350Q9GZX5 532 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 HMG20AQ9NP66 347 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 FBXO34Q9NWN3 711 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 DTX4Q9Y2E6 619 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 LOXL2Q9Y4K0 774 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 SNX5Q9Y5X3 404 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 ZNF292O60281 2723 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 GXYLT2A0PJZ3 443 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 ANKRD34BA5PLL1 514 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 DPM1O60762 260 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 STX11O75558 287 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 HEXBP07686 556 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 CLK3P49761 638 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 ALDH3A2P51648 485 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 ARHGDIAP52565 204 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 ARPC4P59998 168 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 PPP2R2BQ00005 443 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 FIGNL1Q6PIW4 674 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 USP43Q70EL4 1123 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 AKAP14Q86UN6 197 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 HIPK1Q86Z02 1210 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 LACC1Q8IV20 430 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 OR52P1PQ8NH57 321 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 OR14A16Q8NHC5 309 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 SLC2A12Q8TD20 617 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 PMEPA1Q969W9 287 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 OSBPL10Q9BXB5 764 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 PINK1Q9BXM7 581 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 ULBP3Q9BZM4 244 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 TESMINQ9Y4I5 508 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 ENPP4Q9Y6X5 453 aa8.05□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 IDSB3KWA1 339 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 ADAMDEC1O15204 470 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 CLPSP04118 112 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 ITIH1P19827 911 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 TGM1P22735 817 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 DCKP27707 260 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 RRM2P31350 389 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 CAPGP40121 348 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 MAP2K4P45985 399 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 SLC37A1P57057 533 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 NCS1P62166 190 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 EPS8Q12929 822 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 GPR68Q15743 365 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 ISXQ2M1V0 245 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 COLEC12Q5KU26 742 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 FAAH2Q6GMR7 532 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 LANCL3Q6ZV70 420 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 GALNT5Q7Z7M9 940 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 PEX5LQ8IYB4 626 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 ART5Q96L15 291 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 BEX2Q9BXY8 128 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 SLC26A1Q9H2B4 701 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 Q9N2J8 555 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 SLC13A4Q9UKG4 626 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 CHST2Q9Y4C5 530 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 VSTM2BA6NLU5 285 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 FFAR1O14842 300 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 DNAJB5O75953 348 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 KCNK2O95069 426 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 DDAH2O95865 285 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 LGI1O95970 557 aa8.04□□□□□ -1.12
THBS3-210ENST00000541576 RHCEP18577 417 aa8.04□□□□□ -1.12
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