RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FKRPQ9H9S5 495 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD274Q9NZQ7 290 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF639Q9UID6 485 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MCM8Q9UJA3 840 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa8.92□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BANF1O75531 89 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDE5AO76074 875 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRKD3O94806 890 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AVPP01185 164 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MLNP12872 115 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADRA2CP18825 462 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ME2P23368 584 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SHC1P29353 583 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SERPINB1P30740 379 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GGT5P36269 586 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAC1P63000 192 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TBCCQ15814 346 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM44Q2T9K0 475 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARMC3Q5W041 872 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FCRLAQ7L513 359 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 P2RY8Q86VZ1 359 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RELL1Q8IUW5 271 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SYCE1Q8N0S2 351 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LILRA2Q8N149 483 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TXLNBQ8N3L3 684 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TCAIMQ8N3R3 496 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDYL2Q8N8U2 506 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HES6Q96HZ4 224 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SIGLEC10Q96LC7 697 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNF145Q96MT1 663 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCT8L2Q96SF2 557 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MOKQ9UQ07 419 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC25A15Q9Y619 301 aa8.91□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GOLGA6L10A6NI86 522 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CBFA2T2O43439 604 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KERAO60938 352 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PGM3O95394 542 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATP1B1P05026 303 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLK1P06870 262 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MSMBP08118 114 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DDX5P17844 614 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GIFP27352 417 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SERPINF1P36955 418 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR3A2P47893 321 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLK3P49761 638 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SULT1C3Q6IMI6 304 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VHLLQ6RSH7 139 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UGT2A3Q6UWM9 527 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF100Q8IYN0 542 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBE2J2Q8N2K1 259 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLHL29Q96CT2 875 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLHL15Q96M94 604 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD244Q9BZW8 370 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SAP130Q9H0E3 1048 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CXorf36Q9H7Y0 433 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PFDN4Q9NQP4 134 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NTMQ9P121 344 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TENM3Q9P273 2699 aa8.9□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TTC4O95801 387 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANGPTL1O95841 491 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PNPP00491 289 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF17P17021 662 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PGAM1P18669 254 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ENPP1P22413 925 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PIK3CBP42338 1070 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PIK3CGP48736 1102 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ALDH9A1P49189 494 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TAS2R39P59534 338 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB10P61026 200 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR4D1Q15615 310 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRHL2Q6ISB3 625 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC48A1Q6P1K1 146 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC170Q8IYT3 715 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VSTM2LQ96N03 204 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB1BQ9H0U4 201 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TIGARQ9NQ88 270 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TREM2Q9NZC2 230 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CES1P1Q9UKY3 287 aa8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa8.88□□□□□ -0.99
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SH3PXD2BA1X283 911 aa8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.6 ms