RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 IL6P05231 212 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 GP1BBP13224 206 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 BMP7P18075 431 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 SRD5A2P31213 254 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 PHC1P78364 1004 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 ADORA2A-AS1P86434 159 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 PMPCAQ10713 525 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 FLYWCH1Q4VC44 716 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 EMC4Q5J8M3 183 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 C1orf185Q5T7R7 199 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM211Q6ICI0 200 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 ENPP6Q6UWR7 440 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 ZAR1Q86SH2 424 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 RPRMLQ8N4K4 120 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF527Q8NB42 609 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 XAGE5Q8WWM1 108 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 RND1Q92730 232 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 RAB8BQ92930 207 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 CCDC115Q96NT0 180 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 UGT2B28Q9BY64 529 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 UBQLN4Q9NRR5 601 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 EXD2Q9NVH0 621 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 ZIM2Q9NZV7 527 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 BTNL2Q9UIR0 455 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 PCNX3Q9H6A9 2034 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa10.43□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM234BA2RU67 622 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 WIPF3A6NGB9 483 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM90A27PA6NNH2 459 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 H3BNH8 94 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 HCRTR2O43614 444 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 CLDN1O95832 211 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 VIMP08670 466 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 OR12D1P0DN82 309 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 COL8A1P27658 744 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 DCTP40126 519 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 MAP3K8P41279 467 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 CDKN2CP42773 168 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 CCR4P51679 360 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 GAS1P54826 345 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 NUP107P57740 925 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 C17orf67Q0P5P2 114 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 LRRC74AQ0VAA2 488 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 GPR68Q15743 365 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 GPAT3Q53EU6 434 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 DCST1Q5T197 706 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 PPP4R4Q6NUP7 873 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 AAGABQ6PD74 315 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 RNF130Q86XS8 419 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 UBQLNLQ8IYU4 475 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 MARVELD2Q8N4S9 558 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 OR2M3Q8NG83 312 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 OR5M1Q8NGP8 315 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 OR4C3Q8NH37 302 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 RFWD2Q8NHY2 731 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 SMPDL3BQ92485 455 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 VPS33AQ96AX1 596 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 ITCHQ96J02 903 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 DMRTA2Q96SC8 542 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 TIMP4Q99727 224 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 CCDC28BQ9BUN5 200 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 OR2B2Q9GZK3 357 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 SERHL2Q9H4I8 314 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 MED4Q9NPJ6 270 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 VDAC3Q9Y277 283 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 COL12A1Q99715 3063 aa10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 H3BML4 177 aa10.41□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 ADAM10O14672 748 aa10.41□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 SEC14L5O43304 696 aa10.41□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 EDF1O60869 148 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 SCN2BO60939 215 aa10.41□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 STX11O75558 287 aa10.41□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 CYP7B1O75881 506 aa10.41□□□□□ -0.74
UBASH3B-208ENST00000533451 SOX30O94993 753 aa10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.1 ms