RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523200.5

TNIP1-217, Transcript of TNFAIP3 interacting protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNIP1, Length 1,743 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1-217ENST00000523200 ILKQ13418 452 aa14.61□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa14.61□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 GDF7Q7Z4P5 450 aa14.61□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 ZER1Q7Z7L7 766 aa14.61□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 SATL1Q86VE3 508 aa14.61□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa14.61□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 FAM81AQ8TBF8 368 aa14.61□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 METTL21AQ8WXB1 218 aa14.61□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 RNF31Q96EP0 1072 aa14.61□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 SCN3BQ9NY72 215 aa14.61□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 TPRKBQ9Y3C4 175 aa14.61□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 TRAPPC13A5PLN9 417 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 OR6C76A6NM76 312 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 IDSB3KWA1 339 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 NPIPB9F8W1W9 429 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 MEN1O00255 615 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 LINGO3P0C6S8 592 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 GKN3PP0CG01 181 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 MMP11P24347 488 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 IDH2P48735 452 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 MC2RQ01718 297 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 FGFBP1Q14512 234 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 NADK2Q4G0N4 442 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 BROXQ5VW32 411 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 LAIR2Q6ISS4 152 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 ZNF773Q6PK81 442 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 SLC29A4Q7RTT9 530 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 ENTHD1Q8IYW4 607 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 BMPERQ8N8U9 685 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 ADIPOR1Q96A54 375 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 CTRCQ99895 268 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 ZNF559Q9BR84 538 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 NUDT9Q9BW91 350 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 TMEM27Q9HBJ8 222 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 FBXO8Q9NRD0 319 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 RXFP3Q9NSD7 469 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 IMPAD1Q9NX62 359 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 REV1Q9UBZ9 1251 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 SLC7A7Q9UM01 511 aa14.6□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 VSTM2BA6NLU5 285 aa14.59□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 ZAR1LA6NP61 321 aa14.59□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 H3BN98 237 aa14.59□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 IL33O95760 270 aa14.59□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 POU1F1P28069 291 aa14.59□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 GSSP48637 474 aa14.59□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 OR1Q1Q15612 314 aa14.59□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 LANCL3Q6ZV70 420 aa14.59□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 ZNF550Q7Z398 422 aa14.59□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 P3H2Q8IVL5 708 aa14.59□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 ZNF527Q8NB42 609 aa14.59□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa14.59□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 PIGXQ8TBF5 258 aa14.59□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 GAL3ST4Q96RP7 486 aa14.59□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 SLC26A1Q9H2B4 701 aa14.59□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 VCX3AQ9NNX9 186 aa14.59□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 RASSF1Q9NS23 344 aa14.59□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 RNF6Q9Y252 685 aa14.59□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 NTNG1Q9Y2I2 539 aa14.59□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 FER1L5A0AVI2 2057 aa14.58□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 MPZL2O60487 215 aa14.58□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 ALOX12BO75342 701 aa14.58□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 CYC1P08574 325 aa14.58□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 ZNF806P0C7X5 589 aa14.58□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 PRG2P13727 222 aa14.58□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 HPGDP15428 266 aa14.58□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 LCN1P31025 176 aa14.58□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 CCKBRP32239 447 aa14.58□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 ALDH3B2P48448 385 aa14.58□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 EMP2P54851 167 aa14.58□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 EBPQ15125 230 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 FAAH2Q6GMR7 532 aa14.58□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 ZNF613Q6PF04 617 aa14.58□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 NKAIN4Q8IVV8 208 aa14.58□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 RHOXF1Q8NHV9 184 aa14.58□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 CMKLR1Q99788 373 aa14.58□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 UBQLN4Q9NRR5 601 aa14.58□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
TNIP1-217ENST00000523200 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TNIP1-217ENST00000523200 SERINC4A6NH21 518 aa14.58□□□□□ -0.08
TNIP1-217ENST00000523200 ABCB7O75027 752 aa14.58□□□□□ -0.08
TNIP1-217ENST00000523200 THY1P04216 161 aa14.58□□□□□ -0.08
TNIP1-217ENST00000523200 HTR2AP28223 471 aa14.58□□□□□ -0.08
TNIP1-217ENST00000523200 FMO3P31513 532 aa14.58□□□□□ -0.08
TNIP1-217ENST00000523200 KRT20P35900 424 aa14.58□□□□□ -0.08
TNIP1-217ENST00000523200 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms