RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516577.1

RNU6-1018P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1018, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1018P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NEURL3Q96EH8 262 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 VPS39Q96JC1 886 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TAAR1Q96RJ0 339 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 S1PR3Q99500 378 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 APOOQ9BUR5 198 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MAGT1Q9H0U3 335 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SWAP70Q9UH65 585 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MICAL3Q7RTP6 2002 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 STRCP1A6NGW2 1772 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PRR14LQ5THK1 2151 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SAGE2PA6NJ88 616 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 F5H0A9 414 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 J3KRW8 73 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PDLIM1O00151 329 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SOCS1O15524 211 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CCNKO75909 580 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGLV2-23P01705 113 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ALOX12P18054 663 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CYP3A5P20815 502 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GCKP35557 465 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CXCL5P42830 114 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KIR2DS2P43631 304 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GZMMP51124 257 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 VLDLRP98155 873 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC3A1Q07837 685 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ST3GAL3Q11203 375 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 WTAPQ15007 396 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 UGCGQ16739 394 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CYP51A1Q16850 503 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 METTL11BQ5VVY1 283 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C19orf35Q6ZS72 473 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PARGQ86W56 976 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR4L1Q8NH43 312 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CAB39LQ9H9S4 337 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RETNQ9HD89 108 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 AIG1Q9NVV5 245 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 VPS18Q9P253 973 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CRLS1Q9UJA2 301 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DOCK6Q96HP0 2047 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 A0A0J9YVX5 310 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ILVBLA1L0T0 632 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MAGEB16A2A368 324 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NPIPA5E9PKD4 350 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SELENOFO60613 162 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 REC8O95072 547 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TXNDC12O95881 172 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CHRNA1P02708 482 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GSTA2P09210 222 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CHTF8P0CG12 524 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TPBGLP0DKB5 382 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ALPPL2P10696 532 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CCNA2P20248 432 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CPT2P23786 658 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PSMA3P25788 255 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RPS6P62753 249 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PRKCDQ05655 676 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CDC20Q12834 499 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ARFRP1Q13795 201 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TRADDQ15628 312 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HAGHQ16775 308 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMEM183BQ1AE95 376 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CRY2Q49AN0 593 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF789Q5FWF6 425 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAM120AOSQ5T036 256 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAM205BPQ63HN1 556 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DNM1P46Q6ZS02 220 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ARMCX2Q7L311 632 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ADM2Q7Z4H4 148 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMEM183AQ8IXX5 376 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NECAP1Q8NC96 275 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C1orf64Q8NEQ6 169 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CKAP2Q8WWK9 683 aa-0.33□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms