RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 WASP42768 502 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-221ENST00000511747 MFSD12Q6NUT3 480 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-221ENST00000511747 NRROSQ86YC3 692 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-221ENST00000511747 ZFPM2Q8WW38 1151 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-221ENST00000511747 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-221ENST00000511747 TIMM29Q9BSF4 260 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-221ENST00000511747 KCNN2Q9H2S1 579 aa25.23■■□□□ 1.63
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SH3BP2-221ENST00000511747 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
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SH3BP2-221ENST00000511747 A0A0X1KG70 313 aa25.23■■□□□ 1.63
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SH3BP2-221ENST00000511747 WDR45Q9Y484 360 aa25.23■■□□□ 1.63
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SH3BP2-221ENST00000511747 BDH1Q02338 343 aa25.22■■□□□ 1.63
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SH3BP2-221ENST00000511747 TBX5Q99593 518 aa25.22■■□□□ 1.63
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SH3BP2-221ENST00000511747 C10orf90Q96M02 699 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2-221ENST00000511747 NECTIN4Q96NY8 510 aa25.21■■□□□ 1.63
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SH3BP2-221ENST00000511747 CADM2Q8N3J6 435 aa25.2■■□□□ 1.63
SH3BP2-221ENST00000511747 HDDC3Q8N4P3 179 aa25.2■■□□□ 1.63
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
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SH3BP2-221ENST00000511747 MS4A4EQ96PG1 132 aa25.2■■□□□ 1.63
SH3BP2-221ENST00000511747 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
SH3BP2-221ENST00000511747 HDHD2Q9H0R4 259 aa25.2■■□□□ 1.63
SH3BP2-221ENST00000511747 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
SH3BP2-221ENST00000511747 SCN3AQ9NY46 2000 aa25.2■■□□□ 1.63
SH3BP2-221ENST00000511747 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2-221ENST00000511747 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF136P52737 540 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2-221ENST00000511747 RAB25P57735 213 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF425Q6IV72 752 aa25.2■■□□□ 1.62
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SH3BP2-221ENST00000511747 HBMQ6B0K9 141 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-221ENST00000511747 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-221ENST00000511747 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-221ENST00000511747 SMARCD2Q92925 531 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-221ENST00000511747 PRSS27Q9BQR3 290 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-221ENST00000511747 CYSLTR2Q9NS75 346 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-221ENST00000511747 TEAD1P28347 426 aa25.19■■□□□ 1.62
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