RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 ALG1L2C9J202 215 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 H0YC42 278 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 OIP5O43482 229 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 SASH3O75995 380 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 EPPINO95925 133 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF708P17019 499 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 IGFBP2P18065 325 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 MSX1P28360 303 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 PTGER4P35408 488 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF136P52737 540 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 DGKQP52824 942 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 LACC1Q8IV20 430 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 NATD1Q8N6N6 113 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC35G5Q96KT7 338 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR45Q9Y5Y3 372 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 PDZD2O15018 2839 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 TRPC5OSA6NMA1 111 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 CLCA1A8K7I4 914 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 AHRRA9YTQ3 701 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 KLF11O14901 512 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 NGFRP08138 427 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 TBXA2RP21731 343 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 NDUFAF6Q330K2 333 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 NXNQ6DKJ4 435 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 POMZP3Q6PJE2 187 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 UBQLNLQ8IYU4 475 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 ADAMTS15Q8TE58 950 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 MOAP1Q96BY2 351 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 CLCF1Q9UBD9 225 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 VDAC3Q9Y277 283 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 TACC2O95359 2948 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2M5A3KFT3 312 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 H3BML4 177 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 NDUFB5O43674 189 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 TNFRSF21O75509 655 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 CPN1P15169 458 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 BMP5P22003 454 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 GCKP35557 465 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 CDKN2CP42773 168 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 CLDN15P56746 228 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 FUT5Q11128 374 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 GANABQ14697 944 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 C6orf120Q7Z4R8 191 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 OR9I1Q8NGQ6 314 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 ARSGQ96EG1 525 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 INPP5KQ9BT40 448 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 ENKD1Q9H0I2 346 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 OR51I1Q9H343 314 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 SDHAF3Q9NRP4 125 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 CD8B2A6NJW9 211 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 SEC14L5O43304 696 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 CHMP24386 653 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 CLK3P49761 638 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF117Q03924 483 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 C17orf67Q0P5P2 114 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 AAGABQ6PD74 315 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 ENPP6Q6UWR7 440 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 HDXQ7Z353 690 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 SPATA19Q7Z5L4 167 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 ZPLD1Q8TCW7 415 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 SMPDL3BQ92485 455 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNJ16Q9NPI9 418 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 UBQLN4Q9NRR5 601 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF337Q9Y3M9 751 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 USH1CQ9Y6N9 552 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-218ENST00000511185 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 NPIPB9F8W1W9 429 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 SCDO00767 359 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 DIAPH2O60879 1101 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
SH3BP2-218ENST00000511185 MATN1P21941 496 aa16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms