RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498801.5

GARNL3-222, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-222ENST00000498801 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 MPEG1Q2M385 716 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 AGKQ53H12 422 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 SFT2D3Q587I9 215 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 SPANXN4Q5MJ08 99 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 C19orf48Q6RUI8 117 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 NATD1Q8N6N6 113 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 OR8J2Q8NGG1 315 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 SUN3Q8TAQ9 357 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 SPSB4Q96A44 273 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 C8orf44Q96CB5 159 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 IMMP1LQ96LU5 166 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 AMDHD1Q96NU7 426 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 BBS4Q96RK4 519 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 TRIB1Q96RU8 372 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 DUSP26Q9BV47 211 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 NMUR2Q9GZQ4 415 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 ADAP2Q9NPF8 381 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 P4HTMQ9NXG6 502 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 CCDC167Q9P0B6 97 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 FBXL4Q9UKA2 621 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 SCN2AQ99250 2005 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 CCDC88CQ9P219 2028 aa6.84□□□□□ -1.31
GARNL3-222ENST00000498801 A0A1W2PRB8 838 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 SAGE2PA6NJ88 616 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 A8MUA0 341 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 C17orf105B2RV13 164 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 DIRC3C9JPN6 131 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 NR5A2O00482 541 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 PEX12O00623 359 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 SLC22A2O15244 555 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 DCTN3O75935 186 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 NT5EP21589 574 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 GALNSP34059 522 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 FRKP42685 505 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 KCNK10P57789 538 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 CBX1P83916 185 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 HSPB3Q12988 150 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 KLF10Q13118 480 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 RCAN2Q14206 197 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 LTB4RQ15722 352 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 ANXA8L1Q5VT79 327 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 PLAG1Q6DJT9 500 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 OR4F3Q6IEY1 312 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 IGFL3Q6UXB1 125 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 NDUFAF7Q7L592 441 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 FUNDC1Q8IVP5 155 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 CLEC1AQ8NC01 280 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 CCDC197Q8NCU1 140 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 PSD4Q8NDX1 1056 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 OR9A2Q8NGT5 310 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 OR14A16Q8NHC5 309 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 EXTL1Q92935 676 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 RIT1Q92963 219 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 OR52E6Q96RD3 313 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 ADOQ96SZ5 270 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 LPAR4Q99677 370 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 TUBB6Q9BUF5 446 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 ING2Q9H160 280 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 MYLK2Q9H1R3 596 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 GLIPR2Q9H4G4 154 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 CXorf21Q9HAI6 301 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 ARMCX1Q9P291 453 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 CAPN7Q9Y6W3 813 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.83□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 CACNA1GO43497 2377 aa6.82□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 A0A087WV62 115 aa6.82□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa6.82□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa6.82□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.82□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 DYTNA2CJ06 578 aa6.82□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 CLCA1A8K7I4 914 aa6.82□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 MKRN2OSH3BPM6 223 aa6.82□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 CFLARO15519 480 aa6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms