RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498524.5

ANKRD28-213, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-213ENST00000498524 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 IL37Q9NZH6 218 aa3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 SEC14L3Q9UDX4 400 aa3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 ENTPD4Q9Y227 616 aa3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 DHRS7Q9Y394 339 aa3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 DOCK5Q9H7D0 1870 aa3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 XKRY2A2RUG3 117 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 MROH6A6NGR9 719 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 OR6C70A6NIJ9 312 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 CLCA1A8K7I4 914 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 WASH4PA8MWX3 477 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 SSX5O60225 188 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 OR10H3O60404 316 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 UBXN7O94888 489 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 DKK1O94907 266 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 DHFRP00374 187 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 FYNP06241 537 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 BCKDHAP12694 445 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 CTPS1P17812 591 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 CR2P20023 1033 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 CFL1P23528 166 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 ERP29P30040 261 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 HLA-FP30511 346 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 GGT5P36269 586 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 UGT2B10P36537 528 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 CCT3P49368 545 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 HTR6P50406 440 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 FBXW4P57775 412 aa3.69□□□□□ -1.82
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ANKRD28-213ENST00000498524 FOXO1Q12778 655 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 AQP6Q13520 282 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 ARHGAP19Q14CB8 494 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 XKR7Q5GH72 579 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 XKR6Q5GH73 641 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM76BQ5HYJ3 339 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 SLX4IPQ5VYV7 408 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 XAF1Q6GPH4 301 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 OR4F3Q6IEY1 312 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM111BQ6SJ93 734 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 LCTLQ6UWM7 567 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 DPPA4Q7L190 304 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 OVCH2Q7RTZ1 564 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 CAMKMTQ7Z624 323 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 LYSMD2Q8IV50 215 aa3.69□□□□□ -1.82
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ANKRD28-213ENST00000498524 OR52J3Q8NH60 311 aa3.69□□□□□ -1.82
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ANKRD28-213ENST00000498524 FAM110BQ8TC76 370 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 SORCS1Q8WY21 1168 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 VWCEQ96DN2 955 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 C12orf66Q96MD2 445 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF583Q96ND8 569 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 TRIB3Q96RU7 358 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 TPPP3Q9BW30 176 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 CD244Q9BZW8 370 aa3.69□□□□□ -1.82
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ANKRD28-213ENST00000498524 TUBB1Q9H4B7 451 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 IL1RAPQ9NPH3 570 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 CENPMQ9NSP4 180 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 NUDT15Q9NV35 164 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 TMLHEQ9NVH6 421 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 REV1Q9UBZ9 1251 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF639Q9UID6 485 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 ASF1AQ9Y294 204 aa3.69□□□□□ -1.82
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ANKRD28-213ENST00000498524 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 BDP1A6H8Y1 2624 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 H0Y8G0 127 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 KIAA0513O60268 411 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 GADD45GO95257 159 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 C8GP07360 202 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 INHBBP09529 407 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 RAB40ALP0C0E4 278 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 PRR35P0CG20 571 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 TGM1P22735 817 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 IFNGR2P38484 337 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 CLDN8P56748 225 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC35A2P78381 396 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 S100A12P80511 92 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 MC2RQ01718 297 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 PCDH1Q08174 1060 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 EXT1Q16394 746 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 CTF1Q16619 201 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC5A12Q1EHB4 618 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-213ENST00000498524 GPR33Q49SQ1 333 aa3.69□□□□□ -1.82
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