RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC35A4	Q96G79	324 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR22	Q99680	433 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	RBBP8	Q99708	897 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	CPNE1	Q99829	537 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	IPPK	Q9H8X2	491 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	NGB	Q9NPG2	151 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		9.69	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	DBX1	A6NMT0	343 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	SSX4	O60224	188 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	UGDH	O60701	494 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	AQP8	O94778	261 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	CLDN9	O95484	217 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	SOD3	P08294	240 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	CLDN20	P56880	219 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	DR1	Q01658	176 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	GTF2H2	Q13888	395 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	SGO1	Q5FBB7	561 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	LGSN	Q5TDP6	509 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	MED11	Q9P086	117 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	SENP1	Q9P0U3	644 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		9.68	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2M5	A3KFT3	312 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	C17orf51	A8MQB3	221 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	OVOL3	O00110	214 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	GMFG	O60234	142 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	GPRIN2	O60269	458 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	SYNGR4	O95473	234 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV4-39	P01824	125 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	IL32	P24001	234 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	IVD	P26440	423 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	CRABP2	P29373	138 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	SSTR1	P30872	391 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	EVI2B	P34910	448 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	EMD	P50402	254 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	NUDT6	P53370	316 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	PNLIPRP2	P54317	469 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	CORO7	P57737	925 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	PSPH	P78330	225 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	MGAT2	Q10469	447 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	IFT88	Q13099	833 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF124	Q15973	351 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	FRG2	Q64ET8	278 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP112	Q8N8E3	955 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2M3	Q8NG83	312 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	FRG2B	Q96QU4	278 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF639	Q9UID6	485 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		9.67	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM234B	A2RU67	622 aa		9.66	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPAN2	O60636	221 aa		9.66	□□□□□ -0.86

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