RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490813.5

CEP170-216, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CEP170, Length 1,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-216	ENST00000490813	C21orf58	P58505	322 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	IRF9	Q00978	393 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	LGALS3BP	Q08380	585 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF844	Q08AG5	666 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	KIF5A	Q12840	1032 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	CHIT1	Q13231	466 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	SNX1	Q13596	522 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	CUL3	Q13618	768 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	TGFBI	Q15582	683 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	C18orf63	Q68DL7	685 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813		Q6ZT83	130 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	NUDT13	Q86X67	352 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	SLC43A2	Q8N370	569 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	FADS6	Q8N9I5	356 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	SNX31	Q8N9S9	440 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	OR7G3	Q8NG95	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	HES6	Q96HZ4	224 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	BTBD9	Q96Q07	612 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	INPP5K	Q9BT40	448 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	DSN1	Q9H410	356 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	MYNN	Q9NPC7	610 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	MED29	Q9NX70	200 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	AHSP	Q9NZD4	102 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	VWF	P04275	2813 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	C1orf226	A1L170	272 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	VSTM5	A8MXK1	200 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813		B4DSR2	109 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	PLPP1	O14494	284 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	ADAMDEC1	O15204	470 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	TSPAN2	O60636	221 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	RAMP1	O60894	148 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	KERA	O60938	352 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	PRKD3	O94806	890 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	ATP1B1	P05026	303 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	TACSTD2	P09758	323 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	PCNA	P12004	261 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	PGAM1	P18669	254 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	GGT1	P19440	569 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	GDF5	P43026	501 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	ARFIP2	P53365	341 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	CLDN20	P56880	219 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	RINL	Q6ZS11	566 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	OR2M3	Q8NG83	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	OR10D3	Q8NH80	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	RNF138	Q8WVD3	245 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	TMBIM1	Q969X1	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	C3orf49	Q96BT1	292 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	MTBP	Q96DY7	904 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	ADO	Q96SZ5	270 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	HBEGF	Q99075	208 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	ITPA	Q9BY32	194 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	NTN4	Q9HB63	628 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF639	Q9UID6	485 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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