RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 STMN3Q9NZ72 180 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1W2PPV9 198 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 B4GAT1O43505 415 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 FARS2O95363 451 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 KRT8P05787 483 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 GDF1P27539 372 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 CYB561P49447 251 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 EMP3P54852 163 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 ZIC1Q15915 447 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 MAPK14Q16539 360 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 DUSP5Q16690 384 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 HES3Q5TGS1 186 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 MZT2AQ6P582 158 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 DNAJC22Q8N4W6 341 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 FAM86B1Q8N7N1 296 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 NDUFB2O95178 105 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 MED26O95402 600 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 NUBP1P53384 320 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 MLC1Q15049 377 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 ENTPD8Q5MY95 495 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 GPR107Q5VW38 600 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 RHBDD2Q6NTF9 364 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF793Q6ZN11 406 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 RNF121Q9H920 327 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 OSMP13725 252 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 PDX1P52945 283 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 MVKQ03426 396 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 DNASE1L3Q13609 305 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 PDE7AQ13946 482 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 OR1Q1Q15612 314 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM178AQ8NBL3 297 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 NUDT8Q8WV74 236 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF160Q9HCG1 818 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 FAM86C1Q9NVL1 165 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 CD300AQ9UGN4 299 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 KLF15Q9UIH9 416 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 H3BML4 177 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 RAD1O60671 282 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 FUCA1P04066 466 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 CD2P06729 351 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF84P51523 738 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 QSOX2Q6ZRP7 698 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 SLC25A45Q8N413 288 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 OR1J4Q8NGS1 313 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 SAP25Q8TEE9 199 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 DUSP19Q8WTR2 217 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 CENPMQ9NSP4 180 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 MYO10Q9HD67 2058 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 UPK1AO00322 258 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 DNAJB5O75953 348 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 SFTPDP35247 375 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 NUDT6P53370 316 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 IST1P53990 364 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 HOXC5Q00444 222 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 TLE3Q04726 772 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF528Q3MIS6 628 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 C5orf46Q6UWT4 87 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 LINC00696Q6ZRV3 163 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 AP3S1Q92572 193 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 UFD1Q92890 307 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 CRELD1Q96HD1 420 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 SH3GL3Q99963 347 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 SERHL2Q9H4I8 314 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 CDCP1Q9H5V8 836 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 SERHLQ9NQF3 203 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 NCOR1O75376 2440 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 GP1BAP07359 652 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 PEPDP12955 493 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF43P17038 809 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 FUT1P19526 365 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 MSX1P28360 303 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 LSM3P62310 102 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 FOXC1Q12948 553 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 SPANXN2Q5MJ10 180 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 C16orf52Q8NHV5 167 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRD-211ENST00000486161 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms