RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 FAM9CQ8IZT9 166 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 ANKS4BQ8N8V4 417 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 OR5M1Q8NGP8 315 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 CEP70Q8NHQ1 597 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 PPP3R2Q96LZ3 170 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 BBS4Q96RK4 519 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 UCN2Q96RP3 112 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 SMR3AQ99954 134 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 SFXN3Q9BWM7 321 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 DSN1Q9H410 356 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 LRTM1Q9HBL6 345 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 C1orf109Q9NX04 203 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 MED11Q9P086 117 aa11.42□□□□□ -0.58
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PRAME-212ENST00000485532 A0A1W2PNV4 684 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 A8MXE2 369 aa11.41□□□□□ -0.58
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PRAME-212ENST00000485532 ABCB7O75027 752 aa11.41□□□□□ -0.58
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PRAME-212ENST00000485532 MC3RP41968 323 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 PNLIPRP2P54317 469 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 CLDN15P56746 228 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 FAM27E3Q08E93 113 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 EFR3AQ14156 821 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 HEPACAMQ14CZ8 416 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 SPDYAQ5MJ70 313 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 VWA1Q6PCB0 445 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 AAGABQ6PD74 315 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 TMEM107Q6UX40 140 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 Q71RC1 249 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 CAMKMTQ7Z624 323 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 OR4K17Q8NGC6 315 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 MARK4Q96L34 752 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 ZFP3Q96NJ6 502 aa11.41□□□□□ -0.58
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PRAME-212ENST00000485532 OR10H1Q9Y4A9 318 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 MYO1GB0I1T2 1018 aa11.4□□□□□ -0.58
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PRAME-212ENST00000485532 HCRTR2O43614 444 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 GMFGO60234 142 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 FADS1O60427 444 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 SEC22BO75396 215 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 CD53P19397 219 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 DDCP20711 480 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 CHMP24386 653 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 MPIP34949 423 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP11.4□□□□□ -0.582e-8■□□□□ 8.3
PRAME-212ENST00000485532 RPL38P63173 70 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 EMX2Q04743 252 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 KIAA0040Q15053 153 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 SMU1Q2TAY7 513 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 FAM71E1Q6IPT2 247 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 GALNT18Q6P9A2 607 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 FADS6Q8N9I5 356 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 OR2M3Q8NG83 312 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 FIG4Q92562 907 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 ERP27Q96DN0 273 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 STARD4Q96DR4 205 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 FCRL1Q96LA6 429 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 DACH2Q96NX9 599 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 C1orf50Q9BV19 199 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 NMUR2Q9GZQ4 415 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 MYLK2Q9H1R3 596 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 ZNF385DQ9H6B1 395 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 TAS2R9Q9NYW1 312 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 PACSIN3Q9UKS6 424 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 ZNF337Q9Y3M9 751 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-212ENST00000485532 SHISA8B8ZZ34 492 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 UPK1AO00322 258 aa11.39□□□□□ -0.59
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PRAME-212ENST00000485532 SEC14L5O43304 696 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 HK1P19367 917 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 RFX3P48380 749 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 DIO3P55073 304 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 CLDN20P56880 219 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 SIRPAP78324 504 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 ZNF763Q0D2J5 394 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 GAB1Q13480 694 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 IL23RQ5VWK5 629 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 RAET1LQ5VY80 246 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 METTL21CQ5VZV1 264 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 P4HA3Q7Z4N8 544 aa11.39□□□□□ -0.59
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