RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 OR12D1P0DN82 309 aa19■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 ATP6V1C1P21283 382 aa19■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 PTGER4P35408 488 aa19■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 PM20D2Q8IYS1 436 aa19■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 GATSQ8NAP1 163 aa19■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 SDCCAG3Q96C92 435 aa19■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 HOXD1Q9GZZ0 328 aa19■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 PTGES2Q9H7Z7 377 aa19■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 RNF6Q9Y252 685 aa19■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 CYSRT1A8MQ03 144 aa18.99■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 PRSS44E7EML9 344 aa18.99■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 NPIPB9F8W1W9 429 aa18.99■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 SCDO00767 359 aa18.99■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 HPGDP15428 266 aa18.99■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 HK1P19367 917 aa18.99■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 GCKP35557 465 aa18.99■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 DCTP40126 519 aa18.99■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 STARP49675 285 aa18.99■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 CD226Q15762 336 aa18.99■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa18.99■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa18.99■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 ZNF621Q6ZSS3 439 aa18.99■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 SEM1Q6ZVN7 128 aa18.99■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 TRIML2Q8N7C3 387 aa18.99■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 VPS33AQ96AX1 596 aa18.99■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa18.99■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 SFXN2Q96NB2 322 aa18.99■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 SLC6A13Q9NSD5 602 aa18.99■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 COQ3Q9NZJ6 369 aa18.99■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 CAMK2AQ9UQM7 478 aa18.99■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa18.99■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 PCNX3Q9H6A9 2034 aa18.98■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 FAM234BA2RU67 622 aa18.98■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 FCMRO60667 390 aa18.98■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 EPPINO95925 133 aa18.98■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 AK1P00568 194 aa18.98■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 CPN1P15169 458 aa18.98■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 CHMP24386 653 aa18.98■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 GRNP28799 593 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 ADH7P40394 386 aa18.98■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 LHX2P50458 406 aa18.98■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 ATP12AP54707 1039 aa18.98■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 GANABQ14697 944 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 FLYWCH1Q4VC44 716 aa18.98■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 KLHL26Q53HC5 615 aa18.98■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP18.98■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa18.98■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 OLIG3Q7RTU3 272 aa18.98■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 RNF130Q86XS8 419 aa18.98■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 MISPQ8IVT2 679 aa18.98■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 XAGE5Q8WWM1 108 aa18.98■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 STON2Q8WXE9 905 aa18.98■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 RAB8BQ92930 207 aa18.98■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 HHATLQ9HCP6 504 aa18.98■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 EXD2Q9NVH0 621 aa18.98■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa18.97■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 RFXANKO14593 260 aa18.97■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 GMFGO60234 142 aa18.97■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 MSX1P28360 303 aa18.97■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 HTR1EP28566 365 aa18.97■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 STX1BP61266 288 aa18.97■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 FUT5Q11128 374 aa18.97■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 TIGD2Q4W5G0 525 aa18.97■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 AP1ARQ63HQ0 302 aa18.97■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 AAGABQ6PD74 315 aa18.97■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 ENPP6Q6UWR7 440 aa18.97■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 ARSKQ6UWY0 536 aa18.97■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 FUNDC1Q8IVP5 155 aa18.97■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa18.97■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 RFWD2Q8NHY2 731 aa18.97■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 ASB5Q8WWX0 329 aa18.97■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 KLHDC3Q9BQ90 382 aa18.97■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 ZNF350Q9GZX5 532 aa18.97■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 A0A0G2JNJ9 132 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 HMGN4O00479 90 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 STX11O75558 287 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 TOXO94900 526 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 AGR2O95994 175 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 KHKP50053 298 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 CLDN18P56856 261 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 C16orf62Q7Z3J2 963 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa18.96■□□□□ 0.63
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