RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 SLC1A7O00341 560 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 FMO6PO60774 539 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 RLN2P04090 185 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 GDF1P27539 372 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 RAB38P57729 211 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 ZNF619Q8N2I2 560 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 ZNF565Q8N9K5 539 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 OR8J1Q8NGP2 316 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 SLA2Q9H6Q3 261 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 TMEM9BQ9NQ34 198 aa12.82□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 ZNF878C9JN71 531 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 TAPBPO15533 448 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 HSPA12AO43301 675 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 CSF2P04141 144 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 MAP2K4P45985 399 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 UBE2UQ5VVX9 321 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 SLC6A16Q9GZN6 736 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 SLC6A15Q9H2J7 730 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 MT-ND2P03891 347 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 PRKCAP17252 672 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 PTNP21246 168 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 SRYQ05066 204 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 ALG10BQ5I7T1 473 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 PM20D2Q8IYS1 436 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 ZNF675Q8TD23 568 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 SLC6A18Q96N87 628 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 MYADMQ96S97 322 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 CFHR5Q9BXR6 569 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 TWSG1Q9GZX9 223 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 MMACHCQ9Y4U1 282 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 ATE1O95260 518 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 DAP3P51398 398 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 GABARAPL2P60520 117 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 PRPS1P60891 318 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 SELPLGQ14242 412 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 SWI5Q1ZZU3 235 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 C9orf50Q5SZB4 431 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 CD300LGQ6UXG3 332 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 LINGO2Q7L985 606 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 MARCH9Q86YJ5 346 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 LILRB4Q8NHJ6 448 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 CHFRQ96EP1 664 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 IL21Q9HBE4 155 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 C14orf119Q9NWQ9 140 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 UBQLN2Q9UHD9 624 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 CDC14CA4D256 554 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 SLC22A31A6NKX4 558 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 SCGB2A1O75556 95 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 PEX11BO96011 259 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 FUT4P22083 530 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 BCL7AQ4VC05 210 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 BORAQ6PGQ7 559 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 ABHD11Q8NFV4 315 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 LYSMD1Q96S90 227 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 CMAHPQ9Y471 501 aa12.81□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 SLCO2B1O94956 709 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 KCNJ8Q15842 424 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 ZADH2Q8N4Q0 377 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 SEMA6CQ9H3T2 930 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 SPHK1Q9NYA1 384 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 CDH10Q9Y6N8 788 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 A6NLC8 198 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 GPR75O95800 540 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 UGT2B7P16662 529 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 NDUFV2P19404 249 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 CBLP22681 906 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 TAP2Q03519 686 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 ECH1Q13011 328 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 MLC1Q15049 377 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 MISPQ8IVT2 679 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 HS3ST5Q8IZT8 346 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 SLC44A3Q8N4M1 653 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 ZNF639Q9UID6 485 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 PEPDP12955 493 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 TNFSF4P23510 183 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 OPRL1P41146 370 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 PPP5CP53041 499 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 ACTA2P62736 377 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 ACTG2P63267 376 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 CARD17Q5XLA6 110 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 IQCF2Q8IXL9 164 aa12.8□□□□□ -0.36
NISCH-207ENST00000479054 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms