RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473542.1

BBX-223, Transcript of BBX, HMG-box containing, human

TSL 3

Gene BBX, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBX-223	ENST00000473542	PAX2	Q02962	417 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	SELPLG	Q14242	412 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542		Q1RN00	199 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	TEX44	Q53QW1	395 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	FBXO30	Q8TB52	745 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	ERP44	Q9BS26	406 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	DUSP16	Q9BY84	665 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	DPM3	Q9P2X0	92 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	PRODH2	Q9UF12	536 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	SNX6	Q9UNH7	406 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		3.58	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	FAM74A7	A6NL05	159 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542		A8MX80	341 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	OR1F1	O43749	312 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	GMFG	O60234	142 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	CRLF1	O75462	422 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	B3GAT3	O94766	335 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	SLC2A10	O95528	541 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	CD55	P08174	381 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	ALPI	P09923	528 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	UMPS	P11172	480 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	PGC	P20142	388 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	CA8	P35219	290 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	XCR1	P46094	333 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	GNPDA1	P46926	289 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	IFNAR2	P48551	515 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	SPIB	Q01892	262 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	RUNX3	Q13761	415 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	DPYSL3	Q14195	570 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	MESD	Q14696	234 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	SLC10A1	Q14973	349 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	USH1G	Q495M9	461 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	CYS1	Q717R9	158 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	TM2D1	Q9BX74	207 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	PALMD	Q9NP74	551 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	WDR45	Q9Y484	360 aa		3.57	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542		H0YCG3	227 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	KIAA0754	O94854	1291 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	IQCF3	P0C7M6	154 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	NPIPA8	P0DM63	369 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	PRG2	P13727	222 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	CPN1	P15169	458 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	RPA2	P15927	270 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	ATP6V1C1	P21283	382 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	HMGCL	P35914	325 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	PLA2G16	P53816	162 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	NUCB2	P80303	420 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	CBX1	P83916	185 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	CNTN2	Q02246	1040 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	RGS1	Q08116	209 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	ZNF154	Q13106	437 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	CHI3L2	Q15782	390 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	EIPR1	Q53HC9	387 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	CFAP157	Q5JU67	520 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	VASH2	Q86V25	355 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	CDC20B	Q86Y33	519 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	SYT14	Q8NB59	555 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		3.56	□□□□□ -1.84
BBX-223	ENST00000473542	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84

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