RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 GINS1Q14691 196 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 DEFB133Q30KQ1 61 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 FLYWCH1Q4VC44 716 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 EIPR1Q53HC9 387 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 SYT14P1Q58G82 188 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 CT45A2Q5DJT8 189 aa5.23□□□□□ -1.57
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PTPRC-210ENST00000462363 CCNJQ5T5M9 372 aa5.23□□□□□ -1.57
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PTPRC-210ENST00000462363 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa5.23□□□□□ -1.57
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PTPRC-210ENST00000462363 VMP1Q96GC9 406 aa5.23□□□□□ -1.57
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF649Q9BS31 505 aa5.23□□□□□ -1.57
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PTPRC-210ENST00000462363 JAM3Q9BX67 310 aa5.23□□□□□ -1.57
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PTPRC-210ENST00000462363 ADAP2Q9NPF8 381 aa5.23□□□□□ -1.57
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PTPRC-210ENST00000462363 COQ9O75208 318 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 CLPXO76031 633 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 DDAH2O95865 285 aa5.22□□□□□ -1.57
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PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD34CP0C6C1 535 aa5.22□□□□□ -1.57
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PTPRC-210ENST00000462363 NCF4Q15080 339 aa5.22□□□□□ -1.57
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PTPRC-210ENST00000462363 MOGQ16653 247 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 SYT16Q17RD7 645 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-210ENST00000462363 ZSWIM7Q19AV6 140 aa5.22□□□□□ -1.57
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