RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa21.71■■□□□ 1.07
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SMKR1-201ENST00000462322 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
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SMKR1-201ENST00000462322 CD226Q15762 336 aa21.66■■□□□ 1.06
SMKR1-201ENST00000462322 PLXDC2Q6UX71 529 aa21.66■■□□□ 1.06
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