RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 TUBA1CQ9BQE3 449 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 BTBD2Q9BX70 525 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ACTRT3Q9BYD9 372 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 PIGUQ9H490 435 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 CAMK2AQ9UQM7 478 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 USH1CQ9Y6N9 552 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 PDZD2O15018 2839 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 CENPEQ02224 2701 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 APCP25054 2843 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ALG1L2C9J202 215 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 E9PBE3 544 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 NPIPB9F8W1W9 429 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 EFNA2O43921 213 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 FCMRO60667 390 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNH1O95259 989 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 CLDN14O95500 239 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 EPPINO95925 133 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 OPN1LWP04000 364 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 GSNP06396 782 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ALOX5P09917 674 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 OR12D1P0DN82 309 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 HK1P19367 917 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 IL11P20809 199 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 AGAP20933 346 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 TBXA2RP21731 343 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 DPP4P27487 766 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 SRD5A2P31213 254 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 SOAT1P35610 550 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 RPL3P39023 403 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 PRIM2P49643 509 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 IDH3AP50213 366 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF136P52737 540 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 DLX5P56178 289 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 CLDN18P56856 261 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 SRYQ05066 204 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 MAPK11Q15759 364 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 MAPK14Q16539 360 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM44Q2T9K0 475 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 KLHL26Q53HC5 615 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 COX20Q5RI15 118 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 DCST2Q5T1A1 773 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 SAXO2Q658L1 398 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 NXNQ6DKJ4 435 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM211Q6ICI0 200 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 CBLN3Q6UW01 205 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 SPATA19Q7Z5L4 167 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 HMGN2P46Q86SG4 172 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 FUNDC1Q8IVP5 155 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC34Q8IZ02 419 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ACBD4Q8NC06 268 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 OR14L1PQ8NHC6 308 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 LILRB4Q8NHJ6 448 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 RFWD2Q8NHY2 731 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 POC1BQ8TC44 478 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 SFXN5Q8TD22 340 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ACTRT2Q8TDY3 377 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 JADE3Q92613 823 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 RND1Q92730 232 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB8BQ92930 207 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 STACQ99469 402 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 OR51I1Q9H343 314 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 VIPAS39Q9H9C1 493 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC52A3Q9NQ40 469 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 DUSP22Q9NRW4 184 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ATAD3AQ9NVI7 634 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 TAS2R10Q9NYW0 307 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ABCG2Q9UNQ0 655 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF337Q9Y3M9 751 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-206ENST00000461017 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms