RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 CASP3P42574 277 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 CRATP43155 626 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 CLK3P49761 638 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 MEOX1P50221 254 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 FADDQ13158 208 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 RUNDC3AQ59EK9 446 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 COX20Q5RI15 118 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM180AQ6UWF9 173 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 C16orf62Q7Z3J2 963 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF554Q86TJ5 538 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 MSRB3Q8IXL7 192 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 OR2M7Q8NG81 312 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 RAB8BQ92930 207 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 MCUR1Q96AQ8 359 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 CMTM5Q96DZ9 223 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 CGREF1Q99674 301 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 DOHHQ9BU89 302 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 HOXD1Q9GZZ0 328 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 DEPPQ9NTK1 212 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 GID8Q9NWU2 228 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 NDUFA13Q9P0J0 144 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 ABCG2Q9UNQ0 655 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 LIPT1Q9Y234 373 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 PRAMEF25A6NGN4 478 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 HMGN4O00479 90 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 STX11O75558 287 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 UTS2O95399 124 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 C1QCP02747 245 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 NGFRP08138 427 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 GUSBP08236 651 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 MVDP53602 400 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 GPR85P60893 370 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 RGNQ15493 299 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 CCNJQ5T5M9 372 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 PRAMEF20Q5VT98 475 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 REP15Q6BDI9 236 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 DESI1Q6ICB0 168 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 TREML1Q86YW5 311 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 RNF138Q8WVD3 245 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 NTNG2Q96CW9 530 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 SDF2Q99470 211 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 IL1RL2Q9HB29 575 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 PROK2Q9HC23 129 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 HHATLQ9HCP6 504 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 POLE3Q9NRF9 147 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 KLRF1Q9NZS2 232 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 G3V3Y1 287 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 FADS1O60427 444 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 ICOSLGO75144 302 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 SEMA7AO75326 666 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 TBXA2RP21731 343 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 DNASE1L1P49184 302 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 DSTNP60981 165 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 POU5F2Q8N7G0 328 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 GRHL3Q8TE85 626 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 WDR60Q8WVS4 1066 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 ROPN1LQ96C74 230 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM41AQ96HV5 264 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 TAAR6Q96RI8 345 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 SH3GL1Q99961 368 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 OSBPL11Q9BXB4 747 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 EFCAB1Q9HAE3 211 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 SDHAF3Q9NRP4 125 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 UBQLN4Q9NRR5 601 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 FBXO34Q9NWN3 711 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A0G2JMM0 328 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1W2PPB8 328 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1W2PRS3 328 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM247A6NEH6 219 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 KIR3DP1A8MWS1 328 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 BMP2P12643 396 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 ETFAP13804 333 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 GPX2P18283 190 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 EVI2BP34910 448 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 PTGDSP41222 190 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 HPCAP84074 193 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 PLGLB1Q02325 96 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 GNA13Q14344 377 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGEF1-205ENST00000450873 GRAMD1BQ3KR37 738 aa9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms