RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 AP3D1O14617 1153 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 HS6ST1O60243 411 aa8.54□□□□□ -1.04
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CCNDBP1-202ENST00000444658 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 CYP7B1O75881 506 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 CCNB2O95067 398 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 MT-CO3P00414 261 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 CCDC159P0C7I6 412 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 TNFRSF1BP20333 461 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 TBXA2RP21731 343 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC5A2P31639 672 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 IFNGR2P38484 337 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 CDH12P55289 794 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 ESRRGP62508 458 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 CSNK2BP67870 215 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPIBQ01892 262 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 FGFBP1Q14512 234 aa8.54□□□□□ -1.04
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CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF691Q5VV52 312 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 CLIP4Q8N3C7 705 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 ATG16L2Q8NAA4 619 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF527Q8NB42 609 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 APCDD1LQ8NCL9 501 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRSS33Q8NF86 280 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR10G2Q8NGC3 310 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR5L2Q8NGL0 311 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 DIO2Q92813 273 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 FEVQ99581 238 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 LPAR4Q99677 370 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 TUBA1CQ9BQE3 449 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF559Q9BR84 538 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 NUDT9Q9BW91 350 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 ITPAQ9BY32 194 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 GABARAPL3Q9BY60 117 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR8D2Q9GZM6 311 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 ING2Q9H160 280 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF556Q9HAH1 456 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 HHATLQ9HCP6 504 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 FBXO34Q9NWN3 711 aa8.54□□□□□ -1.04
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CCNDBP1-202ENST00000444658 OR10H1Q9Y4A9 318 aa8.54□□□□□ -1.04
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CCNDBP1-202ENST00000444658 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa8.54□□□□□ -1.04
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CCNDBP1-202ENST00000444658 MYO15AQ9UKN7 3530 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 RP1P56715 2156 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 VPS13AQ96RL7 3174 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A1W2PQD3 144 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 SH3PXD2BA1X283 911 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 J3KTA2 159 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 PLD2O14939 933 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 TPST2O60704 377 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 NME6O75414 186 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 ADAP00813 363 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGKV1D-16P01601 117 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 CBLP22681 906 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF136P52737 540 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 ISL1P61371 349 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 RNF4P78317 190 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 TEKQ02763 1124 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 NPRL3Q12980 569 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRAM2Q15035 370 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 NPTX1Q15818 432 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 CCNJQ5T5M9 372 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 STPG1Q5TH74 334 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 C1orf94Q6P1W5 598 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF613Q6PF04 617 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 FIGNL1Q6PIW4 674 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF836Q6ZNA1 936 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF550Q7Z398 422 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLCO6A1Q86UG4 719 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 SATL1Q86VE3 508 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 COMTD1Q86VU5 262 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 LACC1Q8IV20 430 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 HS3ST5Q8IZT8 346 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC15A4Q8N697 577 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR4N2Q8NGD1 307 aa8.53□□□□□ -1.04
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