RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437028.5

SNHG11-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 11, human

TSL 3

Gene SNHG11, Length 1,169 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG11-208	ENST00000437028	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	13.96	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	RNF138	Q8WVD3	245 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
SNHG11-208	ENST00000437028		A0A087WV62	115 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC22A20	A6NK97	555 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	SDHD	O14521	159 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	TNFSF13	O75888	250 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	13.95	□□□□□ -0.18	3e-16	■□□□□ 8.3
SNHG11-208	ENST00000437028	LBP	P18428	481 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	SDC1	P18827	310 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	DDC	P20711	480 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	EPHA3	P29320	983 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	POU4F3	Q15319	338 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	SHE	Q5VZ18	495 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	EPGN	Q6UW88	154 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	MAVS	Q7Z434	540 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	OR7G2	Q8NG99	324 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	EGLN2	Q96KS0	407 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	MYNN	Q9NPC7	610 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	ACAN	P16112	2415 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF195	O14628	629 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	ARHGEF9	O43307	516 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	SCO2	O43819	266 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	ZIC3	O60481	467 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	TGM6	O95932	706 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	HK1	P19367	917 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	MAPK1	P28482	360 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	NTS	P30990	170 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	HOXC12	P31275	282 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	IDH3A	P50213	366 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	ARFIP2	P53365	341 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	GAS1	P54826	345 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	C2orf80	Q0P641	193 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	DECR1	Q16698	335 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF385B	Q569K4	471 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	RAET1L	Q5VY80	246 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	FADS6	Q8N9I5	356 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	MED12	Q93074	2177 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	C18orf12	Q96KH6	178 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	C1orf50	Q9BV19	199 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	HHATL	Q9HCP6	504 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028		Q9N2J8	555 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	STOML1	Q9UBI4	398 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	MED12L	Q86YW9	2145 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	TTC36	A6NLP5	189 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	TNFRSF21	O75509	655 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	CD53	P19397	219 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	DRD4	P21917	467 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	CD79B	P40259	229 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	PSG6	Q00889	435 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	IL23R	Q5VWK5	629 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SNHG11-208	ENST00000437028	CGB2	Q6NT52	195 aa		13.93	□□□□□ -0.18

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