RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1W2PNV4	684 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738		A8MXE2	369 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNK2	O95069	426 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	GOSR1	O95249	250 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	CRH	P06850	196 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	MAPK1	P28482	360 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	OCRL	Q01968	901 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	DUSP5	Q16690	384 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	ZAR1	Q86SH2	424 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	LUZP2	Q86TE4	346 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	MEIOB	Q8N635	442 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	OR4C3	Q8NH37	302 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC01560	Q8TB33	94 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	AGR3	Q8TD06	166 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC9A6	Q92581	669 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	ARSG	Q96EG1	525 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	GALNT8	Q9NY28	637 aa		15.98	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	RTTN	Q86VV8	2226 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738		H0YC42	278 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	PEX11A	O75192	247 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	TNFRSF21	O75509	655 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	LAMP1	P11279	417 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	TBXA2R	P21731	343 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	LCN1	P31025	176 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	HPCAL1	P37235	193 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	PCYT1A	P49585	367 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	DIO3	P55073	304 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	PTGR1	Q14914	329 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2A2	Q6IF42	318 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	GALNT10	Q86SR1	603 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		15.97	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1W2PRB8	838 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC22A20	A6NK97	555 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	MSTN	O14793	375 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	15.96	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	ALOX5	P09917	674 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF17	P17021	662 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	CD53	P19397	219 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	CLDN20	P56880	219 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	15.96	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	SHE	Q5VZ18	495 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	SZRD1	Q7Z422	152 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	NATD1	Q8N6N6	113 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	FBXO30	Q8TB52	745 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	FIG4	Q92562	907 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	COQ8B	Q96D53	544 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	STARD4	Q96DR4	205 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	STAC	Q99469	402 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	C1orf50	Q9BV19	199 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	HHATL	Q9HCP6	504 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	GIN1	Q9NXP7	522 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF175	Q9Y473	711 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		15.96	■□□□□ 0.15
MRPL28-203	ENST00000429738		H3BML4	177 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	NDUFB5	O43674	189 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	15.95	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	HEXA	P06865	529 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	CPA2	P48052	419 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	PRIM2	P49643	509 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	15.95	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	GUSBP1	Q15486	140 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	IL23R	Q5VWK5	629 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	VWA1	Q6PCB0	445 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	GGN	Q86UU5	652 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	NUDT8	Q8WV74	236 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	DACH2	Q96NX9	599 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		15.95	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	PINK1	Q9BXM7	581 aa		15.95	■□□□□ 0.14

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms