RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 DIO3P55073 304 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 STX17P56962 302 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 RND3P61587 244 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 DPYSL3Q14195 570 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 CHI3L2Q15782 390 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 SBK1Q52WX2 424 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 FAM120AOSQ5T036 256 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 OR8G2PQ6IF36 304 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 MOB1BQ7L9L4 216 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 OR9A4Q8NGU2 314 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 NUS1Q96E22 293 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 TESK2Q96S53 571 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 ZNF702PQ9H963 129 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 PDFQ9HBH1 243 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 RDH8Q9NYR8 311 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 ACTR3BQ9P1U1 418 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 PDE10AQ9Y233 779 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa3.01□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 WWP2O00308 870 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 SDHDO14521 159 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 SERF1AO75920 110 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 BCKDHAP12694 445 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 CD1EP15812 388 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 DPP4P27487 766 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 AXLP30530 894 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 ADRA1AP35348 466 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 NAPAP54920 295 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 VLDLRP98155 873 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 BCL2L1Q07817 233 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 RGS1Q08116 209 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 PRR4Q16378 134 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 DCST2Q5T1A1 773 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 WSCD1Q658N2 575 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 LANCL3Q6ZV70 420 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 CATSPER4Q7RTX7 472 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 CBWD2Q8IUF1 395 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 CNIH3Q8TBE1 160 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 M1APQ8TC57 530 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 FAM122AQ96E09 287 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 SDSLQ96GA7 329 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 VPS35Q96QK1 796 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 NMUR2Q9GZQ4 415 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 Q9H3A6 140 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 ECT2Q9H8V3 914 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 COG4Q9H9E3 785 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 POLD4Q9HCU8 107 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 TMEM9Q9P0T7 183 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 CRLS1Q9UJA2 301 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 TNRQ92752 1358 aa3□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 DHRS7CA6NNS2 312 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 F8WDY8 70 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 DUX1O43812 170 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 GPX5O75715 221 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 OR4F21O95013 312 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 IGHV3-23P01764 117 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 CYP2F1P24903 491 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 MAGEA5P43359 124 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 NTHL1P78549 312 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 ZNF311Q5JNZ3 666 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 C12orf60Q5U649 245 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 PVRIGQ6DKI7 326 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 OR5M10Q6IEU7 315 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 CXCL17Q6UXB2 119 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 SERPINA9Q86WD7 417 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 GCNT2Q8N0V5 402 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 FEM1AQ9BSK4 669 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 FICDQ9BVA6 458 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 GSDMCQ9BYG8 508 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 CCSER1Q9C0I3 900 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 RHOJQ9H4E5 214 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 RNF6Q9Y252 685 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 CHADO15335 359 aa2.98□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 TRIM16O95361 564 aa2.98□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 MBD3O95983 291 aa2.98□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 AZU1P20160 251 aa2.98□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 VDAC1P21796 283 aa2.98□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 ADORA2BP29275 332 aa2.98□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 RPL29P47914 159 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 BPIFB3P59826 476 aa2.98□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 BDH1Q02338 343 aa2.98□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 ST3GAL3Q11203 375 aa2.98□□□□□ -1.93
RBM39-211ENST00000426951 PDZK1IP1Q13113 114 aa2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms