RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 SGSHP51688 502 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 NRG3P56975 720 aa9.26□□□□□ -0.93
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HERC3-202ENST00000402738 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 H3F3CQ6NXT2 135 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 ABHD13Q7L211 337 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 DPPA2Q7Z7J5 298 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 MFSD6LQ8IWD5 586 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa9.26□□□□□ -0.93
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HERC3-202ENST00000402738 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
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HERC3-202ENST00000402738 ZNF850A8MQ14 1090 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 E2F3O00716 465 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 TNFRSF10BO14763 440 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 SLC16A5O15375 505 aa9.26□□□□□ -0.93
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HERC3-202ENST00000402738 GPR37L1O60883 481 aa9.26□□□□□ -0.93
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HERC3-202ENST00000402738 AAK1Q2M2I8 961 aa9.26□□□□□ -0.93
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HERC3-202ENST00000402738 IL17RDQ8NFM7 739 aa9.26□□□□□ -0.93
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HERC3-202ENST00000402738 ATOH8Q96SQ7 321 aa9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
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HERC3-202ENST00000402738 SLC31A1O15431 190 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 INHAP05111 366 aa9.25□□□□□ -0.93
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HERC3-202ENST00000402738 OR52H1Q8NGJ2 320 aa9.25□□□□□ -0.93
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HERC3-202ENST00000402738 HMX2A2RU54 273 aa9.25□□□□□ -0.93
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HERC3-202ENST00000402738 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
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HERC3-202ENST00000402738 OR4M1Q8NGD0 313 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 OR10R2Q8NGX6 335 aa9.25□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 DGAT2Q96PD7 388 aa9.25□□□□□ -0.93
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