RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402697.5

PRAME-203, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-203ENST00000402697 POM121BA6NF01 834 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 LRRC72A6NJI9 287 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 GPR75O95800 540 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 HLA-DQB1P01920 261 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 STATHP02808 62 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 PAICSP22234 425 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 RPS25P62851 125 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 CD300CQ08708 224 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 DUSP5Q16690 384 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 PRRT3Q5FWE3 981 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 OR2G6Q5TZ20 316 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 OLIG3Q7RTU3 272 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 LNX2Q8N448 690 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 NECTIN4Q96NY8 510 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 UBQLN3Q9H347 655 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 SACM1LQ9NTJ5 587 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 MUTYHQ9UIF7 546 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 CBLCQ9ULV8 474 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 SLC7A7Q9UM01 511 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 CARD8Q9Y2G2 431 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 HTR3EA5X5Y0 456 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 J3QRE1 110 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 SLC19A2O60779 497 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 TMCC2O75069 709 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 COQ9O75208 318 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 CCNKO75909 580 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 EGFP01133 1207 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 MAGP20916 626 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 DRD1P21728 446 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 AKT2P31751 481 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 ATP6V1E1P36543 226 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 MAP3K8P41279 467 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 GCGRP47871 477 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 CTBP2P56545 445 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 TAS2R43P59537 309 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 PPP2CBP62714 309 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 PPP2CAP67775 309 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 GAS6Q14393 721 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 FLYWCH1Q4VC44 716 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 DCST2Q5T1A1 773 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 FCRL6Q6DN72 434 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 SLC30A6Q6NXT4 461 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 RNF44Q7L0R7 432 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 TRIM48Q8IWZ4 208 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 ACBD7Q8N6N7 88 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 COL26A1Q96A83 441 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 SNX18Q96RF0 628 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 SOSTQ9BQB4 213 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 ZNF559Q9BR84 538 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 ZNF649Q9BS31 505 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 MIXL1Q9H2W2 232 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 TPK1Q9H3S4 243 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 SYNPO2LQ9H987 977 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 IL21RQ9HBE5 538 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 TRPV5Q9NQA5 729 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 C14orf119Q9NWQ9 140 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 ZNF221Q9UK13 617 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 GPR52Q9Y2T5 361 aa12.12□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 A0A0G2JNG1 304 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 A0A1W2PS29 197 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 CDHR4A6H8M9 788 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 HMX3A6NHT5 357 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 SLC22A31A6NKX4 558 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 KIR2DS3K7RE56 304 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 CASKO14936 926 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 THY1P04216 161 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 F8A1P23610 371 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 DDOSTP39656 456 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 RBM34P42696 430 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 SRP54P61011 504 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 FABP5Q01469 135 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP12.11□□□□□ -0.479e-8■■■■□ 21.6
PRAME-203ENST00000402697 KIR2DS5Q14953 304 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 DEFB134Q4QY38 66 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 NRARPQ7Z6K4 114 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 TMEM255BQ8WV15 326 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 TMEM239Q8WW34 195 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 PRSS27Q9BQR3 290 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 OR2B2Q9GZK3 357 aa12.11□□□□□ -0.47
PRAME-203ENST00000402697 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms