RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400919.7

FAAP20-204, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FAAP20, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-204ENST00000400919 DPP4P27487 766 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 MSX1P28360 303 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 CA7P43166 264 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 MVDP53602 400 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 KLF10Q13118 480 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 FADDQ13158 208 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 GANABQ14697 944 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 C4orf17Q53FE4 359 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 KLHL26Q53HC5 615 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 FGD2Q7Z6J4 655 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 EID3Q8N140 333 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 FAM26EQ8N5C1 309 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF614Q8N883 585 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 OR2M3Q8NG83 312 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 FAM57AQ8TBR7 257 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 MED11Q9P086 117 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 P2RX2Q9UBL9 471 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 DTNAQ9Y4J8 743 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 CAPN7Q9Y6W3 813 aa24.97■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 NPIPB9F8W1W9 429 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 LRRTM2O43300 516 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 ETFAP13804 333 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 DRD4P21917 467 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 DSTNP60981 165 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 GNA13Q14344 377 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 RGNQ15493 299 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 EIPR1Q53HC9 387 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 C1QL3Q5VWW1 255 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 AP1ARQ63HQ0 302 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 GATSQ8NAP1 163 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 OR2B2Q9GZK3 357 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 VAPAQ9P0L0 249 aa24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa24.95■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa24.95■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 EVPLLA8MZ36 301 aa24.95■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 NPIPA7E9PJI5 369 aa24.95■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 AGFG2O95081 481 aa24.95■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 H6PDO95479 791 aa24.95■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 NPIPA8P0DM63 369 aa24.95■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF141Q15928 474 aa24.95■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 C3AR1Q16581 482 aa24.95■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 MMEL1Q495T6 779 aa24.95■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 WLSQ5T9L3 541 aa24.95■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa24.95■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF619Q8N2I2 560 aa24.95■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 RELTQ969Z4 430 aa24.95■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 SAP130Q9H0E3 1048 aa24.95■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 CALML5Q9NZT1 146 aa24.95■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa24.95■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 TINAGQ9UJW2 476 aa24.95■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 GMEB1Q9Y692 573 aa24.95■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 ZGRF1Q86YA3 2104 aa24.95■■□□□ 1.59
FAAP20-204ENST00000400919 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 ZNHIT1O43257 154 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 KIAA0513O60268 411 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 SNX3O60493 162 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 PER3P56645 1201 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 NFYCQ13952 458 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 DLEU7Q6UYE1 221 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 DHDDSQ86SQ9 333 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 CD163Q86VB7 1156 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 IFNEQ86WN2 208 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 MSRB3Q8IXL7 192 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 PMM1Q92871 262 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 HRH3Q9Y5N1 445 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 RELNP78509 3460 aa24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 C17orf51A8MQB3 221 aa24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 BBIP1A8MTZ0 92 aa24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 HCRTR2O43614 444 aa24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 FUT5Q11128 374 aa24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 CD226Q15762 336 aa24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 SYPL1Q16563 259 aa24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 GXYLT1Q4G148 440 aa24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 COQ5Q5HYK3 327 aa24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 PDZK1Q5T2W1 519 aa24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 AAGABQ6PD74 315 aa24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 FRRS1Q6ZNA5 592 aa24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 RETREG3Q86VR2 466 aa24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 DOLPP1Q86YN1 238 aa24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 ANKFN1Q8N957 763 aa24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 SPRR3Q9UBC9 169 aa24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa24.93■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa24.93■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 CCL21O00585 134 aa24.93■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 UGT2B17O75795 530 aa24.93■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 ACTL6AO96019 429 aa24.93■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
FAAP20-204ENST00000400919 CRISP3P54108 245 aa24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms