RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 SFTPBP07988 381 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 SSTR4P31391 388 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 GIPRP48546 466 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 CHRFAM7AQ494W8 412 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF691Q5VV52 312 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 ELP5Q8TE02 316 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 ERVK-25P63136 954 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 GGTA1PQ4G0N0 100 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 L3MBTL4Q8NA19 623 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 OR8J2Q8NGG1 315 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 OR5AK2Q8NH90 309 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 OR52D1Q9H346 318 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 C2orf42Q9NWW7 574 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 ACOT8O14734 319 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 MAGEA12P43365 314 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 TLE3Q04726 772 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 SPAG16Q8N0X2 631 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 NUDT8Q8WV74 236 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 ISL2Q96A47 359 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 CHFRQ96EP1 664 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 BMFQ96LC9 184 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 BCL7BQ9BQE9 202 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 BTAF1O14981 1849 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 AIFM1O95831 613 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 MTHFD2P13995 350 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 PRPS1P60891 318 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 RTL10Q7L3V2 364 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 ZBP1Q9H171 429 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 OR10A4Q9H209 315 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 GPR75O95800 540 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 MMP12P39900 470 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 RGS6P49758 472 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 ENTPD8Q5MY95 495 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 MLXQ9UH92 298 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 MAB21L2Q9Y586 359 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 TRAV18A0A075B6X5 111 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 TRAV27A0A087WT01 109 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF43P17038 809 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 HSD11B2P80365 405 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 NFATC4Q14934 902 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 CNIH2Q6PI25 160 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIM46Q7Z4K8 759 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 OR5W2Q8NH69 310 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 C16orf58Q96GQ5 468 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 NEDD4LQ96PU5 975 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC5A7Q9GZV3 580 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM168Q9H0V1 697 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC7A11Q9UPY5 501 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 TAPBPO15533 448 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 ITGAMP11215 1152 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC38A5Q8WUX1 472 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 GPR78Q96P69 363 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 SYNPO2LQ9H987 977 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 OR2S2Q9NQN1 319 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 TVP23AA6NH52 213 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 H0YGG7 62 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 CDK4P11802 303 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 CPMP14384 443 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 CD40LGP29965 261 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 PSMB10P40306 273 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 CXCR4P61073 352 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 RPS15P62841 145 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 CDC14CA4D256 554 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 RFXAPO00287 272 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF806P0C7X5 589 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 CAPZA1P52907 286 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 EMP2P54851 167 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 LRRC26Q2I0M4 334 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF765Q7L2R6 523 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 PHC2Q8IXK0 858 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC35F2Q8IXU6 374 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 GDPD1Q8N9F7 314 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 COQ8AQ8NI60 647 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 GGHQ92820 318 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 FKBP10Q96AY3 582 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A1B0GVC2 190 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 A6NIN4 97 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 MMP2P08253 660 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-202ENST00000392011 IL7P13232 177 aa16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms