RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368147.8

SPTA1-201, Transcript of spectrin alpha, erythrocytic 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTA1, Length 7,999 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Dendrite .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1-201ENST00000368147 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ARL6IP5O75915 188 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ADAP00813 363 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 EDN1P05305 212 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 POU2F2P09086 479 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ACVR1BP36896 505 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SCAPQ12770 1279 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 FXNQ16595 210 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 CNTD1Q8N815 330 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 OR51G2Q8NGK0 314 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 TXNDC15Q96J42 360 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 GLTPQ9NZD2 209 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 NFAT5O94916 1531 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 A0A0A6YYH2 397 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 DCDC2BA2VCK2 349 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 A6NJ64 397 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SCELO95171 688 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 STSP08842 583 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 BPIP17213 487 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 CDKN2DP55273 166 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 UBE2G2P60604 165 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 GNB2P62879 340 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 FAM198BQ6UWH4 519 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 OR13C5Q8NGS8 318 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 HUS1BQ8NHY5 278 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 EDAQ92838 391 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 MAL2Q969L2 176 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 CAMK1GQ96NX5 476 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 LPAR4Q99677 370 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SLC30A2Q9BRI3 323 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ALG12Q9BV10 488 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 CD8B2A6NJW9 211 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 GPIP06744 558 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 CD8BP10966 210 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 TNFRSF1BP20333 461 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 IL4RP24394 825 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 FXYD4P59646 89 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ACY1Q03154 408 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 OR8B8Q15620 311 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SPANXN4Q5MJ08 99 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SVBPQ8N300 66 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 PYURFQ96I23 114 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF597Q96LX8 424 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 CD320Q9NPF0 282 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 KLHL13Q9P2N7 655 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 CCL26Q9Y258 94 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 CDH10Q9Y6N8 788 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 CKMT1AP12532 417 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ANXA8P13928 327 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 RHCEP18577 417 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 TM4SF4P48230 202 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ALKBH6Q3KRA9 238 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 CYBRD1Q53TN4 286 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 PPP1R3BQ86XI6 285 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 OR9I1Q8NGQ6 314 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 M1APQ8TC57 530 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 NTAN1Q96AB6 310 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 RNF170Q96K19 258 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 LTBP3Q9NS15 1303 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 MS4A12Q9NXJ0 267 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 FBXO7Q9Y3I1 522 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 A0A096LPI6 279 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 UNC119BA6NIH7 251 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 A8MVM7 634 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 CDK1P06493 297 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 MYF5P13349 255 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 TIMP2P16035 220 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 PGCP20142 388 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SPINT3P49223 89 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SHFQ7M4L6 423 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 FAM58AQ8N1B3 248 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 OR52P1PQ8NH57 321 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 PROKR1Q8TCW9 393 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 PCED1AQ9H1Q7 454 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 EPHA6Q9UF33 1036 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 A0A0D9SG52 128 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SLC1A7O00341 560 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms