RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000347547.6

LRP8-202, Transcript of LDL receptor related protein 8, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP8, Length 2,382 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP8-202ENST00000347547 SLAMF7Q9NQ25 335 aa14.65□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 TRIM36Q9NQ86 728 aa14.65□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 P2RX2Q9UBL9 471 aa14.65□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 ANXA2P2A6NMY6 339 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 SAP18O00422 153 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 PGRMC2O15173 223 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 SEPT4O43236 478 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 PLPP2O43688 288 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 ADAM11O75078 769 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 EPPINO95925 133 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 TRIM23P36406 574 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 CD96P40200 585 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 CCR8P51685 355 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 CCR9P51686 369 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 E2F1Q01094 437 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 GNA13Q14344 377 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 SFRP5Q5T4F7 317 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 ALKAL2Q6UX46 152 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 C17orf107Q6ZR85 190 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 RFLNAQ6ZTI6 216 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 MMP21Q8N119 569 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 SIRT6Q8N6T7 355 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 ZNF454Q8N9F8 522 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 CAPNS2Q96L46 248 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 ZFP3Q96NJ6 502 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 CHIAQ9BZP6 476 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 MTG2Q9H4K7 406 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 BEX1Q9HBH7 125 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 RNF186Q9NXI6 227 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 GPR160Q9UJ42 338 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 ZNF840PA6NDX5 716 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 ZNF749O43361 778 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 IGSF6O95976 241 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 HIST1H2ABP04908 130 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 ATP6V1E1P36543 226 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 GDNFP39905 211 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 OR1G1P47890 313 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 UBXN2BQ14CS0 331 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 PDSS1Q5T2R2 415 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 IER5LQ5T953 404 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 GLB1LQ6UWU2 654 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 TMUB2Q71RG4 321 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 OR5M9Q8NGP3 310 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 SMPDL3AQ92484 453 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 HIST1H2ACQ93077 130 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 ELP4Q96EB1 424 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 CMTM3Q96MX0 182 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 GSAPA4D1B5 854 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 ANKRD61A6NGH8 418 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 SDC3O75056 442 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 AQP8O94778 261 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 STAT5AP42229 794 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 FRKP42685 505 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 SPINT3P49223 89 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 VEGFCP49767 419 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 MANFP55145 182 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 FGL1Q08830 312 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 PGGHGQ32M88 737 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 BBS1Q8NFJ9 593 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 OR5W2Q8NH69 310 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 WBP2Q969T9 261 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 CAMK1GQ96NX5 476 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 ALG8Q9BVK2 526 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 DNTTIP1Q9H147 329 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 EVA1AQ9H8M9 152 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 BCL2L10Q9HD36 194 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 CA10Q9NS85 328 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 NDRG3Q9UGV2 375 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 FLVCR2Q9UPI3 526 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 BRCA2P51587 3418 aa14.62□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa14.62□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 SNRPGP15A8MWD9 76 aa14.62□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 ECDO95905 644 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 HPP00738 406 aa14.62□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 IL5P05113 134 aa14.62□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 ASGR2P07307 311 aa14.62□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 OMPP47874 163 aa14.62□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 MECP2P51608 486 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 MAZP56270 477 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 MAPK14Q16539 360 aa14.62□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 SYPL1Q16563 259 aa14.62□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LRP8-202ENST00000347547 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms