RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 BRWD1Q9NSI6 2320 aa19.29■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC35F4A4IF30 521 aa19.29■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 TRAPPC13A5PLN9 417 aa19.29■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 CDHR4A6H8M9 788 aa19.29■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC2A10O95528 541 aa19.29■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 TSPAN19P0C672 248 aa19.29■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 ZGLP1P0C6A0 271 aa19.29■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC1A3P43003 542 aa19.29■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM44Q2T9K0 475 aa19.29■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa19.29■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 QSOX2Q6ZRP7 698 aa19.29■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 LAX1Q8IWV1 398 aa19.29■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa19.29■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 COX18Q8N8Q8 333 aa19.29■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 FLCNQ8NFG4 579 aa19.29■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 GPR151Q8TDV0 419 aa19.29■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 GATAD2BQ8WXI9 593 aa19.29■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM203Q969S6 136 aa19.29■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 CEP19Q96LK0 163 aa19.29■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 SAMD8Q96LT4 415 aa19.29■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 SPACA6W5XKT8 324 aa19.29■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A0G2JNG1 304 aa19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 KIR2DS3K7RE56 304 aa19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 CDRT1O95170 752 aa19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 LALBAP00709 142 aa19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 IGHA1P01876 353 aa19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 GKN3PP0CG01 181 aa19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 GCGRP47871 477 aa19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 KIR2DS5Q14953 304 aa19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 C22orf42Q6IC83 251 aa19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 OR2T33Q8NG76 320 aa19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 OR4F15Q8NGB8 312 aa19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 RFKQ969G6 155 aa19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 IL20RAQ9UHF4 553 aa19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 CBLCQ9ULV8 474 aa19.28■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 CLEC2LP0C7M8 214 aa19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 HTR1FP30939 366 aa19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 CBX3Q13185 183 aa19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 OR1Q1Q15612 314 aa19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF542PQ5EBM4 170 aa19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 NXNL2Q5VZ03 156 aa19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF438Q7Z4V0 828 aa19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 UFD1Q92890 307 aa19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 UBQLN3Q9H347 655 aa19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 ERVK13-1Q9NX77 482 aa19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 GXYLT2A0PJZ3 443 aa19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 OR5K3A6NET4 321 aa19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 DLGAP3O95886 979 aa19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 IGLV3-19P01714 112 aa19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 CTSBP07858 339 aa19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF79Q15937 498 aa19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 ZAR1Q86SH2 424 aa19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 SYT14Q8NB59 555 aa19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 PFN4Q8NHR9 129 aa19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 NECTIN4Q96NY8 510 aa19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 MED18Q9BUE0 208 aa19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 STARD5Q9NSY2 213 aa19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 C20orf141Q9NUB4 165 aa19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa19.27■□□□□ 0.68
KCNQ1-202ENST00000335475 OR5K4A6NMS3 321 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-202ENST00000335475 BRINP1O60477 761 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-202ENST00000335475 FMO6PO60774 539 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-202ENST00000335475 CBX7O95931 251 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-202ENST00000335475 AK1P00568 194 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-202ENST00000335475 MAKP20794 623 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-202ENST00000335475 GABRA5P31644 462 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-202ENST00000335475 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-202ENST00000335475 RAB38P57729 211 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-202ENST00000335475 MXD1Q05195 221 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-202ENST00000335475 FZD2Q14332 565 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-202ENST00000335475 KIAA0895LQ68EN5 471 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-202ENST00000335475 DESI1Q6ICB0 168 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-202ENST00000335475 FIGNL1Q6PIW4 674 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-202ENST00000335475 HSDL2Q6YN16 418 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-202ENST00000335475 GDPD3Q7L5L3 318 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-202ENST00000335475 JAM3Q9BX67 310 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-202ENST00000335475 DPH1Q9BZG8 443 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-202ENST00000335475 OR52D1Q9H346 318 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM60AQ9NP50 221 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-202ENST00000335475 C14orf119Q9NWQ9 140 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-202ENST00000335475 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-202ENST00000335475 UNC119BA6NIH7 251 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNQ1-202ENST00000335475 H3BQ06 376 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms