RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326298.8

CCNC-201, Transcript of cyclin C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCNC, Length 2,212 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNC-201ENST00000326298 REEP4Q9H6H4 257 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 SLC24A3Q9HC58 644 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 STK38LQ9Y2H1 464 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 TESMINQ9Y4I5 508 aa7.29□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 SONP18583 2426 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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CCNC-201ENST00000326298 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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CCNC-201ENST00000326298 SLU7O95391 586 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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CCNC-201ENST00000326298 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
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CCNC-201ENST00000326298 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.29□□□□□ -1.24
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CCNC-201ENST00000326298 CXorf36Q9H7Y0 433 aa7.29□□□□□ -1.24
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CCNC-201ENST00000326298 V9GYY5 206 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa7.28□□□□□ -1.24
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CCNC-201ENST00000326298 MSTNO14793 375 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 CTIFO43310 598 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 ITM2AO43736 263 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 UGT2B10P36537 528 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 GSTM5P46439 218 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 MANFP55145 182 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 KEAP1Q14145 624 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.241e-7■■■■■ 35
CCNC-201ENST00000326298 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 XKR7Q5GH72 579 aa7.28□□□□□ -1.24
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CCNC-201ENST00000326298 PKNOX2Q96KN3 472 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 RNF145Q96MT1 663 aa7.28□□□□□ -1.24
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CCNC-201ENST00000326298 C20orf27Q9GZN8 174 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 SERHL2Q9H4I8 314 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 ATRQ13535 2644 aa7.28□□□□□ -1.24
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CCNC-201ENST00000326298 A0A1W2PRB8 838 aa7.28□□□□□ -1.24
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CCNC-201ENST00000326298 PLAUP00749 431 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 FGF4P08620 206 aa7.28□□□□□ -1.24
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CCNC-201ENST00000326298 EDNRAP25101 427 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 GCKP35557 465 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 PRIM2P49643 509 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 CASP9P55211 416 aa7.28□□□□□ -1.24
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CCNC-201ENST00000326298 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 TSC22D1Q15714 1073 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 PLPPR5Q32ZL2 321 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 METTL25Q8N6Q8 603 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 OR10D3Q8NH80 312 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 OR5AK3PQ8NH89 298 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 JADE3Q92613 823 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 PPP1R36Q96LQ0 422 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 ZFP3Q96NJ6 502 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 MED17Q9NVC6 651 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 KCNE5Q9UJ90 142 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNC-201ENST00000326298 TNFSF11O14788 317 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNC-201ENST00000326298 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CCNC-201ENST00000326298 NDUFB5O43674 189 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNC-201ENST00000326298 TBX19O60806 448 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNC-201ENST00000326298 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CCNC-201ENST00000326298 KCNH1O95259 989 aa7.27□□□□□ -1.25
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