RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 CLN6Q9NWW5 311 aa24.84■■□□□ 1.57
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HOXD8-201ENST00000313173 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
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HOXD8-201ENST00000313173 TRAPPC13A5PLN9 417 aa24.83■■□□□ 1.57
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HOXD8-201ENST00000313173 CT45A2Q5DJT8 189 aa24.82■■□□□ 1.56
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HOXD8-201ENST00000313173 TMEM201Q5SNT2 666 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXD8-201ENST00000313173 ARHGAP40Q5TG30 622 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXD8-201ENST00000313173 KIF18BQ86Y91 864 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXD8-201ENST00000313173 C7orf57Q8NEG2 295 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM255BQ8WV15 326 aa24.81■■□□□ 1.56
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HOXD8-201ENST00000313173 C1orf189Q5VU69 101 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD8-201ENST00000313173 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD8-201ENST00000313173 BCORP1Q8N888 145 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD8-201ENST00000313173 OR4D9Q8NGE8 314 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD8-201ENST00000313173 TEX47Q8TBZ9 253 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD8-201ENST00000313173 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
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