RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303230.5

HCN1-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN1, Length 9,885 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN1-201ENST00000303230 GIMAP1Q8WWP7 306 aa16.03■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 NICN1Q9BSH3 213 aa16.03■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 MCOLN1Q9GZU1 580 aa16.03■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 CPNE7Q9UBL6 633 aa16.03■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 HPGDSO60760 199 aa16.03■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 CXCL14O95715 111 aa16.03■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 ANKRD53Q8N9V6 530 aa16.03■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 POT1Q9NUX5 634 aa16.03■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 MLC1Q15049 377 aa16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 MPEG1Q2M385 716 aa16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 ZNF280BQ86YH2 543 aa16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 ENTHD1Q8IYW4 607 aa16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 ADH5P11766 374 aa16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 CRABP1P29762 137 aa16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 SH3BP2P78314 561 aa16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 ZNF695Q8IW36 515 aa16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 SYNPRQ8TBG9 265 aa16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 TLR9Q9NR96 1032 aa16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 PMM1Q92871 262 aa16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 BORCS6Q96GS4 357 aa16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 TEPSINQ96N21 525 aa16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 MICU1Q9BPX6 476 aa16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 SEC22CQ9BRL7 303 aa16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 OR51B5Q9H339 312 aa16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 VSTM2BA6NLU5 285 aa16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 TMEM212A6NML5 194 aa16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 TNFP01375 233 aa16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 T-ENOLP0DO92 83 aa16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 LBX2Q6XYB7 198 aa16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 ESAMQ96AP7 390 aa16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 SEMA4GQ9NTN9 838 aa16.02■□□□□ 0.16
HCN1-201ENST00000303230 TPPPO94811 219 aa16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 TPMTP51580 245 aa16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 CDC20Q12834 499 aa16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 PPA1Q15181 289 aa16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 LRIT3Q3SXY7 679 aa16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 ZFP82Q8N141 532 aa16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 STEAP2Q8NFT2 490 aa16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 OR5D14Q8NGL3 314 aa16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 MED6O75586 246 aa16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 CNR1P21554 472 aa16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 HLA-DMAP28067 261 aa16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 UBE2KP61086 200 aa16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 HUS1BQ8NHY5 278 aa16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 CACNG3O60359 315 aa16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 NDUFB2O95178 105 aa16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 PGCP20142 388 aa16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 DAP3P51398 398 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 ZNF266Q14584 549 aa16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 PLPP5Q8NEB5 264 aa16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 DDIT4LQ96D03 193 aa16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 PGAM5Q96HS1 289 aa16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 SNED1Q8TER0 1413 aa16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 RPS17P08708 135 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 RPS24P62847 133 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 AMZ1Q400G9 498 aa16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 OR5D16Q8NGK9 328 aa16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 PKD1L3Q7Z443 1732 aa16.01■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 FANCGO15287 622 aa16.01■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 S100A11P31949 105 aa16.01■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 ERVK-16P61578 105 aa16.01■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa16.01■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 NPIPA7E9PJI5 369 aa16.01■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 SERPINE2P07093 398 aa16.01■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 NPIPA8P0DM63 369 aa16.01■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 SLX4IPQ5VYV7 408 aa16.01■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 OR10K1Q8NGX5 313 aa16.01■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 TMEM175Q9BSA9 504 aa16.01■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 LRIT2A6NDA9 550 aa16.01■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 OR5K4A6NMS3 321 aa16.01■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 CAPNS1P04632 268 aa16.01■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 CLDN10P78369 228 aa16.01■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 K7EPK0 472 aa16.01■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 TMEM127O75204 238 aa16.01■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 GDF5P43026 501 aa16.01■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 GPR4P46093 362 aa16.01■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa16.01■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 NETO1Q8TDF5 533 aa16.01■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 GAREM1Q9H706 876 aa16.01■□□□□ 0.15
HCN1-201ENST00000303230 POLHQ9Y253 713 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64 ms